Insgesamt gibt es in Kirgisistan 2044 Flüsse mit einer Länge von mehr als 10 km mit einer Gesamtlänge von etwa 35000 km. Die Liste der Flüsse Kirgisistans umfasst:
A
- Ala-Archa-Fluss
- Alabuga-Fluss
- At-Bashi-Fluss
C
- Chatkal-Fluss
- Fluss Chong-Kemin
- Chu-Fluss
K
- Kara Darya
- Kara-Suu
- Kegart Fluss
- Kichi-Kemin-Fluss
- Kochkor-Fluss
- Kökömeren-Fluss
- Kurschab-Fluss
N
- Fluss Naryn
S
- Sokh-Fluss
T
- Talas-Fluss
- Tar-Fluss (Kirgisistan)
- Toshkan-Fluss
V
- Fluss Vakhsh
Y