Yuji Naka ( 裕司, Naka Yūji, geboren am 17. September 1965) ist ein japanischer Programmierer, Designer und Produzent von Videospielen. Er ist vor allem als ehemaliger Leiter des Sonic Teams bekannt, wo er der leitende Programmierer der ursprünglichen Sonic the Hedgehog-Spieleserie auf dem Sega Genesis war. Im Jahr 2006 gründete er Prope, eine unabhängige Spielefirma. Im Januar 2018 trat er Square Enix bei.