Notts County wurde 1862 gegründet. Der Klub wurde vor dem Fussballverband gegründet und spielte anfangs ein Spiel mit Klubregeln und nicht mit dem Verbandsfussball. Zu Beginn wurde Notts County, wie die meisten Sportmannschaften, als ein "reiner Herrenklub" betrachtet. Man geht davon aus, dass Notts County einer der Starter des aktuellen Spiels ist, dem sogar die Erfindung der Abseitsfalle zugeschrieben wird[]. Notts County ist der älteste Fussballklub der Welt, der dem Berufsverband angehört (es gibt ältere Profiklubs in anderen Codes des Fussballs.)[].
Der Club spielte anfangs in Park Hollow im Nottingham Castle. Im Dezember 1864 wurde die Entscheidung getroffen, Spiele gegen Fremdmannschaften auszutragen, und es wurde beschlossen, dass der Klub ein größeres Stadion finden musste. Nachdem sie an mehreren Orten gespielt hatten, ließen sich The Magpies 1883 auf dem Trent Bridge Cricket Ground nieder. Als der Platz für Cricket genutzt wurde, spielten sie auf dem Castle Ground oder dem Nottingham Forest's Town Ground. Der Club zog 1910 in sein heutiges Stadion, Meadow Lane, um.
Fußball-Liga
1888 wurde Notts County zusammen mit elf anderen Fussballklubs Gründungsmitglied der Football League. Sie beendeten ihre erste Ligasaison auf dem elften Platz. Mit dem dritten Platz in der Liga erreichte Notts County 1890-91 den höchsten je erreichten Ligaabschluss, und zehn Spielzeiten später wurden sie ebenfalls Dritte.
FA-Pokal-Finale
Am 25. März 1891 erreichte Notts County zum ersten Mal das FA-Cup-Finale, konnte es aber nicht gewinnen. Sie verloren mit 1:3 gegen die Blackburn Rovers.
Notts County machte dies 1894 wett, als sie zum ersten Mal in ihrer Geschichte den FA Cup im Goodison Park gewannen. Die Magpies schlugen die Bolton Wanderers mit 4:1, und Jimmy Logan erzielte den ersten Hattrick in der Geschichte des FA-Cup-Finales. Notts County war der erste Klub außerhalb der obersten Liga, der den FA Cup gewann - in dieser Saison belegte man den dritten Platz in der zweiten Liga.