Das Gebiet war die traditionelle Heimat der Yandruwandha, der Aborigines. Der erste Europäer, der das Gebiet besuchte, war Charles Sturt im Jahr 1845. Ihm folgten A. C. Gregory 1858 und dann Burke und Wills. Ein Denkmal für Sturt, Burke und Wills wurde 1944 in Innamincka errichtet.
1882 wurde ein Polizeilager eingerichtet, dem eine kleine Siedlung folgte. Ab dem 7. April 1889 verkehrte vierzehntägig eine Kutsche der Royal Mail von Farina aus, die von den Händlern Davey und Pilkington betrieben wurde. Die Stadt wurde zunächst nach dem Gouverneur von Victoria, dem Earl of Hopetoun, Hopetoun genannt, aber sie war bei den Einheimischen nie beliebt. Die Stadt war nie sehr groß, hatte aber ein Hotel, ein Geschäft und eine Polizeistation. Bis 1901 war die Polizeistation auch die Zollstelle für die Erhebung von Zöllen auf Rinder, die über Land von Queensland nach Südaustralien gebracht wurden. Im Jahr 1928 errichtete die Australische Inlandsmission hier ein Krankenhaus, das Elizabeth Symon Nursing Home. Eine schwere Dürre und der schlechte Zugang zur Siedlung führten zur Schließung des Hotels und des Krankenhauses. Im Jahr 1951 wurde der Polizeiposten geschlossen und die Stadt verlassen.
Der zunehmende Tourismus und die Entdeckung von Gas und Öl in den späten 1960er Jahren führten zur Gründung der Cooper Creek Hotel Motel Pty Ltd. Das Unternehmen eröffnete in der verlassenen Stadt ein Hotel, ein Geschäft und eine Unterkunft. Im Jahr 1994 wurde das Elizabeth Symon Nursing Home von Dick Smith und Australian Geographic restauriert und als Besucherzentrum für südaustralische Parks und Wildtiere genutzt.
Der Stadtplatz am Ufer des Cooper ist bei Campern sehr beliebt, ebenso wie die öffentlichen Toiletten und Duschen der Stadt mit Münzeinwurf.