Transkriptionsfaktoren helfen bei der Genregulation. Jeder Transkriptionsfaktor bindet an eine bestimmte DNA-Sequenz. Auf diese Weise steuern sie die Geschwindigkeit der Transkription der genetischen Information von der DNA zur Boten-RNA.

Ein Transkriptionsfaktor wird manchmal als 'sequenzspezifischer DNA-Bindungsfaktor' bezeichnet. Alleine oder zusammen mit anderen Proteinen fördern oder blockieren sie die RNA-Polymerase. Die RNA-Polymerase ist das Enzym, das die genetische Information für bestimmte Gene von der DNA auf die RNA kopiert.

Transkriptionsfaktoren haben eine oder mehrere DNA-bindende Domänen (DBDs). Diese haften an DNA-Sequenzen neben den Genen, die sie regulieren. Andere Proteine (wie Koaktivatoren, Chromatinremodellierer, Histonacetylasen oder -deacetylasen, Kinasen und Methylasen) spielen ebenfalls eine entscheidende Rolle bei der Genregulation. Da ihnen DNA-bindende Domänen fehlen, werden sie nicht als Transkriptionsfaktoren bezeichnet.

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