Das Wellcome Sanger Institute, früher The Sanger Centre and Wellcome Trust Sanger Institute genannt, ist ein gemeinnütziges britisches Genomik- und Genetik-Forschungsinstitut. Es wird hauptsächlich durch den Wellcome Trust finanziert.
Das Institut befindet sich auf dem Wellcome Genome Campus in der Nähe des Dorfes Hinxton, außerhalb von Cambridge. Auf dem Campus befindet sich auch das Europäische Bioinformatik-Institut. Es wurde 1992 gegründet und nach dem zweifachen Nobelpreisträger Frederick Sanger benannt. Es wurde als ein Zentrum für DNA-Sequenzierung im großen Maßstab konzipiert. Es beteiligte sich am Humangenomprojekt und leistete dann den größten Einzelbeitrag zur Goldstandard-Sequenz des menschlichen Genoms. Von Anfang an verfolgte das Institut eine Politik des Datenaustauschs und betreibt einen Großteil seiner Forschung in Zusammenarbeit.
Seit 2000 hat das Institut seine Mission erweitert, "die Rolle der Genetik in Gesundheit und Krankheit" zu verstehen. Das Institut beschäftigt heute rund 900 Mitarbeiter und forscht in vier Hauptbereichen: Humangenetik, Pathogengenetik, Maus- und Zebrafischgenetik und Bioinformatik.