Wilhelm Roux (9. Juni 1850 in Jena - 15. September 1924 in Halle) war ein deutscher Zoologe, Anatom und Pionier der experimentellen Embryologie.

Zehn Jahre lang arbeitete er in Breslau (heute Breslau) und wurde 1879 Direktor seines eigenen Instituts für Embryologie. Von 1889-95 war er Professor in Innsbruck, Österreich, und nahm dann eine Professur am Anatomischen Institut der Universität Halle an, eine Stelle, die er bis 1921 innehatte.