Roemer war einer von vielen Kandidaten der Demokraten, die den amtierenden Gouverneur Edwin Edwards für drei Amtszeiten herausforderten. Roemer gewann die Wahl mit 33% der Stimmen im Vergleich zu den 28% von Edwards.
Roemer trat am 14. März 1988 in das Gouverneursbüro ein. Im Oktober 1989 lehnten die Wähler eine Reihe von Steuerinitiativen Roemers ab, stimmten aber einer Verfassungsänderung zur Verbesserung des Verkehrs zu. Angesichts eines Defizits von 1,3 Milliarden Dollar im Staatshaushalt bestand seine erste Aufgabe darin, das Defizit zu beseitigen. Roemer berief eine Sondersitzung der Legislative ein, um ein ehrgeiziges Steuer- und Steuerreformprogramm für die Landes- und Kommunalverwaltungen voranzutreiben. Er gelobte, die Ausgaben zu kürzen, Programme abzuschaffen und staatliche Institutionen zu schließen. Die Wähler lehnten seine Vorschläge in einem landesweiten Verfassungsreferendum ab.
Im März 1991 wechselte Roemer wenige Monate vor den Landtagswahlen zur Republikanischen Partei, offenbar auf Drängen von Bush-Stabschef John H. Sununu im Weißen Haus. Roemer verlor seine Wiederwahl, nachdem er die Vorwahl der Republikaner an David Duke verloren hatte. Duke würde bald gegen Edwin Edwards verlieren.
Roemer schied am 13. Januar 1992 aus dem Amt. Er würde erneut für die republikanische Gouverneurskandidatur kandidieren, verlor aber gegen Mike Foster.