Der Abteibezirk erstreckt sich über 28 ha (70 Acres) und ist von einer 3,4 m (11 Fuß) hohen Mauer umgeben. Er wurde im 13. Jahrhundert erbaut. Einige Teile davon sind im Süden und Westen der Abtei sichtbar.
Das Gebiet besteht aus drei konzentrischen Zonen, die vom Fluss Skell durchschnitten werden, der das Gelände von Westen nach Osten durchfließt. Die Kirche und ihre Gebäude stehen in der Mitte des Bezirks nördlich des Skell. Ihr Innenhof enthält Wohngebäude, die sich bis zum Fluss und zum äußeren Hof erstrecken. Er beherbergt die industriellen und landwirtschaftlichen Gebäude.
Die ursprüngliche Abteikirche war aus Holz gebaut und "war wahrscheinlich" zwei Stockwerke hoch. Sie wurde jedoch schnell durch Stein ersetzt. Die Kirche wurde bei dem Angriff auf die Abtei im Jahr 1146 beschädigt und an derselben Stelle in größerem Maßstab wieder aufgebaut. Die Bauarbeiten wurden um 1170 abgeschlossen. Dieses um 1170 fertiggestellte Bauwerk war 91 m (300 ft) lang und hatte 11 Erker in den Seitenschiffen.
Ansicht der Fountains Abbey von Westen nach Süden.
Das Haus des Abtes, eines der größten in ganz England, befindet sich östlich des Latrinenblocks. Teile davon sind an Bögen über dem Fluss Skell aufgehängt. Es wurde in der Mitte des zwölften Jahrhunderts als bescheidener einstöckiger Bau erbaut. Ab dem vierzehnten Jahrhundert wurde es umfassend erweitert und umgestaltet. Im 16. Jahrhundert wurde es zu einem großen Wohnhaus mit schönen Erkern und großen Kaminen. Der große Saal war ein ausgedehnter Raum von 52 x 21 m (171 x 69 ft).
Unter anderen Wohnungen, deren Bezeichnung im Grundriss zu sehen ist, befanden sich ein häusliches Oratorium oder eine Kapelle, 46 1⁄2-by-23-foot (14 x 7 m), und eine Küche, 50 x 38-foot (15 x 12 m).
