Eine Haplogruppe ist eine Gruppe von einzelnen Chromosomen oder einzelnen DNA-Strängen, die einen gemeinsamen Vorfahren haben. Sie haben in allen Versionen die gleiche Mutation.

Haplogruppen zeigen tiefe Ursprünge, die Tausende von Jahren zurückreichen.

In der Humangenetik sind die Haplogruppen, die gewöhnlich untersucht werden, Y-Chromosom-Haplogruppen (Y-DNA) und mitochondriale DNA-Haplogruppen (mtDNA). Beide können zur Definition genetischer Populationen verwendet werden. Y-DNA wird nur vom Vater an den Sohn weitergegeben, während mtDNA nur von der Mutter an die Kinder weitergegeben wird. Keines von beiden rekombiniert, und daher verändern sich Y-DNA und mtDNA nur durch zufällige Mutationen ohne Vermischung zwischen dem genetischen Material der Eltern.