John Michael Bishop (geboren am 22. Februar 1936) ist ein amerikanischer Immunologe und Mikrobiologe. Er teilte sich 1989 den Nobelpreis für Physiologie oder Medizin mit Harold Varmus und war 1984 Mitpreisträger des Alfred P. Sloan-Preises. Derzeit ist er als aktives Fakultätsmitglied an der Universität von Kalifornien, San Francisco, tätig.
Bishop ist am besten bekannt für seine mit dem Nobelpreis ausgezeichneten Arbeiten über retrovirale Onkogene. Bei seiner Zusammenarbeit mit Varmus in den 1980er Jahren entdeckte er das erste menschliche Onkogen, c-Src.
Ihre Ergebnisse zeigten, wie bösartige Tumore aus Veränderungen an den normalen Genen einer Zelle entstehen. Diese Veränderungen können durch Viren, durch Strahlung oder durch die Einwirkung einiger Chemikalien hervorgerufen werden.