Der Generalgouverneur von Pakistan war von 1947 bis 1952 der residierende Vertreter von König Georg VI. in Pakistan und dann von 1952 bis 1956, als Pakistan zur Republik ausgerufen wurde, Königin Elisabeth II.
Als Pakistan 1947 eine unabhängige, selbstverwaltete Nation wurde, fuhr es, wie auch das Indien nach der Unabhängigkeit, vorläufig mit dem Government of India Act 1935 als seiner schriftlichen Verfassung fort, bis eine Verfassung für die Zeit nach der Unabhängigkeit ausgearbeitet werden konnte; standardmäßig sah diese die Fortführung der konstitutionellen Monarchie als Commonwealth-Reich vor.
Der Monarch ernannte auf Anraten des pakistanischen Premierministers einen Generalgouverneur, der de facto als Staatsoberhaupt fungieren sollte.
Muhammad Ali Jinnah, der als Quaid-e-Azam ("Großer Führer") betrachtet wird, informierte Louis Mountbatten, den ersten Earl Mountbatten von Burma: "wenn ich Generalgouverneur bin, wird der Premierminister tun, was ich ihm sage" - doch Jinnahs rapide abnehmende Gesundheit machte die Frage fraglich.
Nach dem Tod Jinnahs spielte der pakistanische Generalgouverneur weiterhin eine größere Rolle, als es das Indien-Gesetz vorschrieb, indem er mehrere Premierminister entließ und die Macht konsolidierte.
Das Amt des Generalgouverneurs wurde durch das Amt des Präsidenten von Pakistan ersetzt, als Pakistan 1956 eine Republik wurde. Der damalige Generalgouverneur, Iskander Mirza, wurde der erste Präsident Pakistans.
