Die Namen der Herrscher der Zweiten Dynastie sind nicht genau bekannt. Die meisten Quellen stimmen über die Namen der ersten Pharaonen überein. Diese sind:
| Name | Regierungsjahre |
| Hotepsekhemwy | 38 |
| Nebra (möglicherweise mit Weneg identifizierbar) | 10–14 |
| Nynetjer | 40 |
| Senedj (vielleicht identifizierbar mit Horus Sa) | 20 |
Die Namen der nächsten zwei oder drei Herrscher sind unklar. Möglicherweise haben wir für diese Herrscher sowohl den Namen Horus oder Nebty (d.h. zwei Damen) als auch ihre Geburtsnamen, es kann sich aber auch um völlig unterschiedliche Individuen handeln; oder es können legendäre Namen sein. Links stehen die Herrscher, die die meisten Ägyptologen hier unterbringen; rechts die Namen aus Manetho's Aegyptica:
| Vorgeschlagener Herrscher | Manetho's Liste |
| Seth-Peribsen | Kaires |
| Nepherkheres |
| Sekhemib-Perenmaat | Sesokhris |
Mit dem letzten Herrscher kehren wir zu einem Abkommen zurück:
| Name | Regierungsjahre |
| Khasekhemwy | 17–18 |
Manetho schrieb, dass sich die Hauptstadt in Thinis befand, die gleiche wie in der Ersten Dynastie. Allerdings wurden zumindest die ersten drei Könige in Saqqara begraben. Dies könnte bedeuten, dass das Machtzentrum nach Memphis verlegt worden war. Darüber hinaus kann über die Ereignisse in dieser Zeit wenig gesagt werden. Die jährlichen Aufzeichnungen über den Stein von Palermo überleben nur für das Ende der Herrschaft von Nebra und für Teile von Nynetjer. Ein wichtiges Ereignis geschah möglicherweise während der Herrschaft von Khasekhemwy: Viele Ägyptologen lesen seinen Namen ("die beiden Mächte erheben sich") als Gedenken an die Vereinigung von Ober- und Unterägypten.