Vor langer Zeit bewahrten die Drachenreiter den Frieden in der Welt zwischen den Menschen, Drachen, Elfen und Zwergen. Es waren Menschen oder Elfen, die an Drachen gebunden waren. Der Drache eines Menschenreiters namens Galbatorix wurde jedoch von den Urgals (einer Spezies, die viel kämpft) getötet. Galbatorix wurde dadurch wahnsinnig. Die Reiter wollten ihm keinen weiteren Drachen geben, also beschloss er, sie zu vernichten. Er stahl einen schwarzen Babydrachen und zwang ihn, sich mit böser Magie mit ihm zu verbinden. Dann kämpften er und andere Verräter mit den Reitern. Schließlich töteten sie sie alle, und Galbatorix wurde König der Menschen. Das Buch Eragon beginnt 100 Jahre danach. Wenn es beginnt, versucht Galbatorix, die Elfen (die sich in einem Wald namens Du Weldenvarden verstecken), die Zwerge (die sich im Beor-Gebirge verstecken - einem gigantischen Gebirge, das weit über die Wolken hinausragt) und die Varden (eine Gruppe von Rebellen, die sich bei den Zwergen versteckt hält) zu finden und zu vernichten. Er hat die Elfen noch nicht vernichtet, denn er ist immer noch vorsichtig mit ihrer Macht. Er hat weder die Varden noch die Zwerge vernichtet, weil er sie in dem großen Gebirge noch nicht finden kann.
Die Geschichte selbst beginnt damit, dass ein kleiner Bauernjunge namens Eragon einen polierten blauen Stein in der Wirbelsäule (einer kleineren Bergkette und Wäldern) fand. Der Stein entpuppt sich als Drachenei, und der Drache, der aus ihm schlüpft, heißt Saphira. Eragons Onkel Garrow wird von den Ra'zac (insektenähnliche Kreaturen, die für Galbatorix arbeiten) getötet, die Eragon und Saphira finden und fangen wollen. Eragon beschließt, sie zu finden und sie aus Rache zu töten, weil sein Onkel gestorben ist. Er und Saphira verlassen zusammen mit Brom, einem alten Geschichtenerzähler, der Eragon und Saphira viele Dinge über Drachen und Reiter erzählt und verspricht, ihnen zu helfen. In Yu'Zuac werden Eragon und Brom von zwei Urgals in einen Hinterhalt gelockt. Nachdem Brom vom Pferd geschlagen worden war, verfolgten die Urgals Eragon, als dieser sie mit Magie besiegte. Brom lehrt Eragon auch, wie er danach die Magie kontrollieren kann. Während sie unterwegs sind, finden sie ein Fläschchen (ein Behälter, der normalerweise Flüssigkeiten wie Wasser enthält) mit verdorbenem Seithr-Öl, das von den Ra'zac abgeworfen wurde. Dieses Öl ist sehr selten, so dass Eragon auf die Idee kommt, in eine Küstenstadt zu fahren, um die Schiffsunterlagen zu holen und die Razac zu finden. Die drei reisen in die Stadt Teirm, um Broms alten Freund Joed zu besuchen. Joed ist ein Händler, der die Varden heimlich mit Vorräten versorgt. Alle seine Schiffe werden jedoch irgendwie von jemandem zerstört, der weiß, dass er für die Varden arbeitet. Er hilft ihnen, eine Aufzeichnung darüber zu finden, wo sich die Ra'zac befinden - eine Stadt namens Dras-Leona. Brom, Eragon und Saphira reisen nach Dras-Leona, aber Eragon wird von den Soldaten von Galbatorix gesehen. Die drei laufen davon, aber die Ra'zac finden sie und nehmen sie gefangen. Dann werden sie von einem Fremden namens Murtagh vertrieben, aber sie verwunden Brom zuerst. Brom stirbt bald, aber nicht bevor er Eragon und Murtagh erzählt, dass er insgeheim ein Reiter war, dessen Drache von Galbatorix getötet wurde.
Eragon und Saphira begraben Brom. Sie beschließen, zu den Varden zu gehen, um gegen Galbatorix zu kämpfen, zusammen mit Murtagh, der nicht gehen will, aber ihnen helfen wird, bis sie die Varden erreichen, aber sie wissen nicht, wo die Varden sind. Sie gehen nach Gilead, einer anderen Stadt, um jemanden zu finden, der weiß, wo die Varden sind. Während Murtagh in der Stadt ist, kommt er zurück, und am nächsten Morgen wird Eragon gefangen genommen, als die drei von weiteren Urgals in einen Hinterhalt gelockt werden. Seine Nahrung und sein Wasser werden unter Drogen gesetzt, um ihn die Magie vergessen zu lassen, damit er nicht entkommen kann. Er merkt, dass man ihm Drogen in sein Essen gibt, und hört auf, das Essen zu essen. Schließlich lassen die Drogen nach, und Eragon kann durch Magie entkommen. Er bricht aus, nur um Murtagh beim Einbruch vorzufinden. Die beiden retten eine Elfe, die sich ebenfalls im Gefängnis befindet. Ihr Name ist Arya. Sie werden von einem Schatten (einem von bösen Geistern beherrschten Zauberer) angegriffen, entkommen aber. Arya ist bewusstlos, aber Eragon kann in Gedanken mit ihr sprechen, und sie sagt ihm, wo die Varden sind. Sie müssen durch eine Wüste gehen, um dorthin zu gelangen, und Arya stirbt an einem Gift, so dass sie sich beeilen müssen. Schließlich schaffen sie es bis zu den Varden (die sich mit den Zwergen im Beor-Gebirge verstecken), aber auf dem Weg dorthin erzählt Murtagh Eragon, dass Murtagh der Sohn von Morzan ist, einem Reiter, der Galbatorix geholfen hat, die anderen Reiter zu töten. Als sie bei den Varden ankommen, wird Murtagh gefangen genommen, weil er Morzans Sohn ist, aber Arya ist geheilt. Dann finden die Varden und ihr Anführer (namens Ajihad) heraus, dass Galbatorix sie mit Urgals angreift. Murtagh wird freigelassen, um den Varden zu helfen, was er auch tut. Es kommt zu einer großen Schlacht. In ihr erscheint der Schatten. Eragon kämpft gegen den Schatten, und mit Hilfe von Arya und Saphira tötet er den Schatten, aber sein Rücken wird vom Schatten mit einem Schwert getroffen. Während Eragon bewusstlos ist, wird er von einer geheimnisvollen Elfe vor dem Tod gerettet, die seinen Geist berührt und den Schmerz blockiert hat. Eragon verspricht, mit Arya für weiteres Training zu den Elfen zu gehen. Eragon wacht auf und stellt fest, dass er von Durzas Schlag vernarbt ist. Das Buch endet damit, dass Eragon sich erneut selbst verspricht, mit Arya zu den Elfen zu gehen.