Linux Mint basiert auf Ubuntu, und beide Distributionen haben viele Gemeinsamkeiten. Beide Distributionen verwenden die gleichen Software-Repositorys. Zum Beispiel verwendet die Version 2.2 ("Bianca") die Paketpools von Ubuntu "Edgy Eft" (6.10). Die meisten Pakete sind auf beiden Distributionen gleich, und die beiden Systeme verhalten sich nahezu identisch.
Die meisten Unterschiede bestehen auf dem Desktop. Ubuntu und Linux Mint konzentrieren sich beide auf die Benutzerfreundlichkeit, aber Linux Mint bietet eine andere Benutzererfahrung, und es enthält eine Reihe von Anwendungen, die in Ubuntu nicht verfügbar sind (siehe oben erwähnte Mint Tools).
Viele beliebte Multimedia-Codecs sind in Linux Mint standardmäßig installiert. Ubuntu und viele andere kostenlose GNU/Linux-Distributionen verteilen diese Codecs aufgrund von Patentbelastungsproblemen nicht mit den ursprünglichen Installationsmedien.
Ubuntu hat eine weitaus größere Support-Community als Linux Mint. Der Großteil der Ubuntu-Hilfe und Beratung ist jedoch auch auf Linux Mint anwendbar. Ubuntu unterstützt mehr Sprachen von der Live-CD und kommt mit besserer Lokalisierung. []