Die Sahara-Pumpentheorie versucht zu erklären, wie Pflanzen und Tiere aus Afrika in den Nahen Osten und dann nach Europa und Asien gelangten.

Damals war Afrika regenreicher als heute, und die Sahara war feuchter, mit größeren Seen und mehr Flüssen.

Afrikanische Regenperioden sind mit einer "feuchten Sahara"-Phase verbunden, während der größere Seen und mehr Flüsse existieren. Dies führt zu Veränderungen in der Art der Tiere, die in diesem Gebiet vorkommen.

Ungeachtet der Trockenheit im Großraum Sahara wurde die Wanderung entlang des Flusskorridors gestoppt, als der Nil während einer Wüstenphase vor 1,8-0,8 Millionen Jahren vollständig zum Stillstand kam und möglicherweise in anderen Perioden aufgrund der nubischen Schwellung nur vorübergehend floss.

Während der Perioden einer feuchten Sahara werden die Sahara und Arabien zu einem Savannen-Grasland, und die afrikanische Flora und Fauna verbreitet sich. Während der anschließenden Trockenperiode kehrt die Sahara in der Regel durch den Rückzug des westafrikanischen Monsuns nach Süden zu Wüstenbedingungen zurück. Die Verdunstung übersteigt den Niederschlag, der Wasserspiegel in Seen wie dem Tschadsee sinkt, und Flüsse werden zu trockenen Wadis.

Flora und Fauna, die früher weit verbreitet waren, ziehen sich nach Norden in das Atlasgebirge, nach Süden nach Westafrika oder nach Osten in das Niltal und von dort entweder nach Südosten in das äthiopische Hochland und nach Kenia oder nach Nordosten über den Sinai nach Asien zurück. Dadurch werden die Populationen einiger Arten in Gebieten mit unterschiedlichem Klima getrennt, was sie zur Anpassung zwingt und möglicherweise zu einer Artbildung führt (Artenaufspaltung).

Die Sahara-Pumpe wurde bisher in vier Wellen menschlicher Auswanderung aus Afrika eingesetzt, nämlich