Drosophila pseudoobscura ist eine Fruchtfliegenart, die ausgiebig in Laborstudien zur Genetik natürlicher Populationen verwendet wird.
Es wurde zuerst von Theodosius Dobzhansky und seinen Kollegen verwendet. Sie sammelten Proben von Populationen im Westen Nordamerikas und Mexikos und züchteten sie in "Populationskäfigen" im Labor. Ihr Interesse galt der natürlichen Selektion, der genetischen Drift und anderen Aspekten der Populationsgenetik.
1989 verabreichte Diane Dodd Laborpopulationen von D. pseudoobscura zwei verschiedene Nahrungstypen, Stärke und Maltose. Sie entwickelten sich nach nur acht Generationen mit den verschiedenen Nahrungsmitteln rasch zu zwei verschiedenen Gruppen. Da beide Gruppen eine starke Präferenz für die Paarung mit ihrem eigenen Typ zeigten, wurde dies als Beispiel für die Speziation durch reproduktive Isolation angeführt. Dodds Experiment wurde von anderen wiederholt und funktioniert auch mit anderen Arten von Fruchtfliegen und anderen Nahrungsmitteln.
Im Jahr 2005 war D. pseudoobscura nach Drosophila melanogaster die zweite Drosophila-Art, deren Genom sequenziert wurde.

