Es gibt inzwischen eine ganze Reihe von Beispielen für natürliche Selektion in natürlichen Populationen.
Antibiotika-Resistenz
Ein bekanntes Beispiel für natürliche Selektion in Aktion ist die Entwicklung von Antibiotikaresistenzen bei Mikroorganismen. Seit der Entdeckung des Penicillins im Jahre 1928 durch Alexander Fleming werden Antibiotika zur Bekämpfung bakterieller Krankheiten eingesetzt. Natürliche Bakterienpopulationen enthalten unter ihrer großen Zahl von Einzelmitgliedern erhebliche Variationen in ihrem genetischen Material, die auf Mutationen zurückzuführen sind. Wenn sie Antibiotika ausgesetzt werden, sterben die meisten Bakterien schnell ab, aber einige haben Mutationen, die sie etwas weniger anfällig machen. Wenn die Exposition gegenüber Antibiotika kurz ist, werden diese Personen die Behandlung überleben. Die Eliminierung von Personen, die keine Resistenz aufweisen, ist ein Beispiel für natürliche Selektion.
Bei ausreichender Zeit und wiederholter Exposition gegenüber dem Antibiotikum wird eine Population von antibiotikaresistenten Bakterien entstehen. Dies führt zu einem so genannten evolutionären Wettrüsten oder einer Ko-Evolution, bei dem Bakterien weiterhin Stämme entwickeln, die weniger anfällig für Antibiotika sind, während medizinische Forscher weiterhin neue Antibiotika entwickeln, die sie abtöten können. Zu den Reaktionsstrategien gehört in der Regel der Einsatz anderer, stärkerer Antibiotika; in letzter Zeit sind jedoch neue MRSA-Stämme aufgetaucht, die selbst gegen diese Medikamente resistent sind. Ähnlich verhält es sich mit der Pestizidresistenz bei Pflanzen und Insekten und mit der Malariaresistenz gegen Chinin.
Tarnung
Eine berühmte Fallstudie ist die Untersuchung der Evolution der Pfeffermotte, und es gibt viele andere Beispiele. Die meisten dieser Eintagsfliegenden Nachtfalter waren von heller Farbe, aber nur wenige der Nachtfalter waren dunkel. Zuerst überlebten die hellen Motten besser, weil sie sich gegen die helle Farbe der nahen Bäume tarnten. Dies machte es den Vögeln schwer, sie zu sehen.
Als die Fabriken gebaut wurden, ließ die Verschmutzung alle Bäume schwarz aussehen. Jetzt waren die hellen Motten gegen die dunkle Rinde zu erkennen. Die dunkel gefärbten Motten waren im Vorteil, nachdem sich die Umwelt verändert hatte. Die Gene, die die dunkle Farbe kontrollieren, verbreiteten sich in der Mottenpopulation. Nach dem Zweiten Weltkrieg wirkten die Kontrollen gegen die Umweltverschmutzung dazu bei, die Umwelt sauberer zu machen. Dann hatten die helleren Motten wieder den Vorteil und sind heute viel häufiger anzutreffen.
Mimikry ist ein weiteres Beispiel: Einige harmlose Insekten imitieren andere Insekten, die gefährlich sind oder einen schlechten Geschmack haben. Die Mimikry entwickelt sich, weil die besseren Nachahmer besser überleben. Sie leben, um mehr Nachkommen zu produzieren als die weniger guten Mimiker. Die Gene der besseren Nachahmer verbreiten sich in der Art immer mehr. Mit der Zeit nähern sich die Mimikry-Arten ihren Vorbildern an.