Ein Gen-Knockout ist eine genetische Technik, bei der ein Gen eines Organismus abgeschaltet oder durch ein nicht funktionierendes Gen ersetzt wird.

Die Organismen, wie z.B. Knockout-Mäuse, werden verwendet, um etwas über ein Gen zu erfahren, das zwar sequenziert wurde, dessen Funktion aber unbekannt oder unvollständig bekannt ist. Aus dem Unterschied zwischen dem Knockout-Organismus und normalen Individuen ziehen die Forscher Rückschlüsse. Knockout wird oft mit KO abgekürzt.

Gen-Knock-in ist der umgekehrte Begriff. Dort wird ein Gen eingeschaltet oder ein funktionierendes Gen eingefügt.