Dr. Tom Jackman (James Nesbitt) ist verheiratet und Vater von zwei Kindern. Er hat seine Familie ohne Erklärung verlassen, um in einer stark befestigten Kellerwohnung zu leben. Er stellt die psychiatrische Krankenschwester Katherine Reimer (Michelle Ryan) ein, um ihm zu helfen. Nachdem er Katherine eine Reihe von ausgeklügelten Sicherheitsvorkehrungen erklärt hat, schnallt er sich in einen Metallstuhl und unterzieht sich einer Verwandlung.
Katherine beobachtet, dass Toms Alter Ego Wut, geschärfte Sinne, Stärke und Schnelligkeit und eine kokette Art zeigt. Sie versichert dieser Persona, dass sie seine Geheimnisse genauso bewahren wird wie die von Tom. Sie bittet um Garantien, dass er ihr nicht schaden wird. Toms Alter Ego nimmt Hyde's Namen an. Die beiden vereinbaren einen unbehaglichen Waffenstillstand. Sie teilen sich einen Körper, aber keiner von beiden erinnert sich daran, was der andere getan hat, als er das Sagen hatte. Sie benutzen einen Mikrokassettenrekorder, um sich gegenseitig Nachrichten zu hinterlassen.
Als Tom begann, sich in den gewalttätigen Hyde zu verwandeln, fürchtete er um die Sicherheit seiner Familie. Er beschloss, sich von ihnen zu isolieren. Er besucht seine Frau Claire (Gina Bellman). Während des Besuchs übernimmt Hyde die Kontrolle und erfährt von Toms Familie.
Miranda Callendar, gespielt von Meera Syal, ist eine von Claire beschäftigte Detektivin. Sie erzählt Tom, dass Jekyll and Hyde keine Fiktion sei, sondern eine Version der tatsächlichen Ereignisse. Miranda zeigt Tom ein Bild des echten Doktors Jekyll, der im 19. Jahrhundert in Edinburgh lebte. Tom ist erschrocken, als er sieht, dass Jekyll genau wie er aussieht.
Tom wird auch von einem privaten Sicherheitsteam beobachtet, das von einem Amerikaner namens Benjamin angeführt und von Paterson Joseph gespielt wird. Das Team arbeitet für seine früheren Arbeitgeber bei der Biotechnologiefirma Klein and Utterson. Das Team wird von seinem Freund Peter Syme, gespielt von Denis Lawson, geleitet.
Als Benjamin Toms Kinder in Gefahr bringt, setzt sich Hyde durch und tötet einen Löwen. Im Krankenhaus wird er von Sophia angesprochen, einer älteren Frau, die behauptet, seine Mutter zu sein, aber bevor er sie befragen kann, verschwindet sie.
Tom konfrontiert Peter, der versucht, ihn unter Drogen zu setzen. Dies provoziert Hyde, aufzutauchen und Peter und Claire als Geiseln zu nehmen. Claire argumentiert, dass sie ein Heilmittel für Toms Zustand finden müssen. Hyde tötet Benjamin. Peter sagt, dass Klein und Utterson schon seit langem ein Heilmittel haben. Tom wird gefangen genommen und in einen Metallsarg gesperrt.
Katherine und Miranda konfrontieren Peter mit der Behauptung, sie wüssten die Wahrheit über Tom. Miranda glaubt, dass Klein und Utterson Zugang zur Klontechnologie haben und dass Tom Jekylls Klon ist. Peter leugnet dies und befiehlt, sie wegzubringen und zu töten.
Peter enthüllt Claire, dass Toms Behandlung ihn zu einer Persona machen wird. Wenn es Hyde ist, wird er zu Forschungszwecken festgehalten. Sie werden den Trank herstellen, der den ursprünglichen Jekyll in Hyde verwandelte. Wenn es Tom ist, wird sie ihn mit nach Hause nehmen können. Wenn die Schachtel geöffnet wird, ist Hyde dominant.
In einer durch das genetische Gedächtnis ausgelösten Rückblende hat Hyde die Vision eines Treffens zwischen Jekyll und Robert Louis Stevenson, dem Autor des Buches Strange Case of Dr. Jekyll and Mr. Hyde. Stevenson willigt ein, eine fiktive Version von Jekylls Fall zu schreiben, verrät aber, dass er die Wahrheit kennt: Es gibt keinen Zaubertrank. Stattdessen wurde Jekyll durch seine Liebe zu Alice, einem Dienstmädchen in seinem Haushalt, in Hyde verwandelt. Rückblenden in Toms eigenes Leben zeigen, dass sein Hyde zum ersten Mal während eines Badeurlaubs mit Claire auftauchte, nachdem die beiden von Hooligans belästigt worden waren.
Wütend über weitere Drohungen gegen Toms Familie flieht Hyde aus Klein und Utterson. Ms. Utterson, eine skrupellose rothaarige Amerikanerin an der Spitze von Klein und Utterson, nimmt Claire und ihre Söhne auf einem Privatanwesen als Geiseln. Sie sperrt die Zwillinge in Miniaturversionen des Sarges ein, der für ihren Vater verwendet wurde.
Toms angebliche Mutter, Sophia, erscheint auf dem Gelände und hilft Claire, aus ihrem verschlossenen Schlafzimmer zu entkommen. Sie erzählt Claire, wie Klein und Utterson versucht hatten, Dr. Jekyll zu klonen, aber erfolglos geblieben waren. Claire trifft im Keller des Gebäudes auf mehrere der fehlgeschlagenen Versuche. Sie sind entstellt und in einem fast vegetativen Zustand. Sophia erklärt, dass Tom durch Mr. Hyde ein Nachfahre von Dr. Jekyll ist und zufällig "ein perfekter Rückschlag, eine Chance unter Millionen". Klein und Utterson hatten dies entdeckt und ihn beobachtet, seit er sechs Monate alt war. Um seine Verwandlung in Hyde auszulösen, schufen sie einen Klon von Alice, dem Dienstmädchen, das Jekyll geliebt hatte. Dieser Klon ist Claire selbst.
Hyde versucht, Toms Familie vor Klein und Utterson zu retten. Er tötet Peter. Es kommt zu einer Pattsituation, bei der die Söhne von Tom und Claire als Geiseln gehalten werden und ersticken. Die Hyde-Persönlichkeit wird offenbar getötet, als er von mehreren Kugeln getroffen wird, und es gelingt ihm dann, es zu vermeiden, "den Schaden zu teilen", indem er die Wunden auf sich nimmt, während er es Tom erlaubt, seine unbeschädigte, gesunde Form anzunehmen, so dass Dr. Jackman als einzige Persönlichkeit übrig bleibt.
Sechs Monate später hat Tom Sophia ausfindig gemacht, die Frau, die sich als seine Mutter ausgab. Als er sie über seinen Vater ausfragt, verrät sie, dass sie die Nachfahrin von Hyde ist. Er hatte den Familienfluch von ihr geerbt. Während Tom entsetzt zusieht, verwandelt sich die machtlose, müde, grauhaarige Sophia in ihre eigene Version der Hyde-Persönlichkeit, die rothaarige Ms. Utterson.