Sorai schrieb viele einflussreiche Werke, in denen er die seiner Meinung nach zwei grundlegenden Probleme der Philosophie des Song-Konfuzianismus aufzeigte. Das erste betraf das Bakufu-Domänensystem, das im achtzehnten Jahrhundert in Schwierigkeiten war. Sorai bezweifelte, dass es ausreichend sei, dass jeder Mensch sein ethisches Gut finden wolle. Er argumentierte, dass die Lösung der politischen Krise der damaligen Zeit mehr erfordere als die Perfektionierung des moralischen Charakters. Er sah auch, dass es den chinesischen Weisenkönigen nicht nur um Moral ging, sondern auch um die Regierung selbst. Der zweite Punkt, in dem Sorai mit dem Song-Konfuzianismus nicht einverstanden war, war, dass er der Meinung war, er lege zu viel Wert auf Moral und unterdrücke die menschliche Natur, da die menschliche Natur auf Emotionen basiere.
Er war der Meinung, dass diese Schwächen keine Schwächen des Konfuzianismus seien; seiner Ansicht nach interpretierten die Lied-Konfuzianer die klassischen Werke der Vier Bücher und der Fünf Klassiker falsch. Nach Soraius Ansicht taten sie dies, weil sie "die alten Worte nicht kannten". Sorai konsultierte die alten Werke, um zuverlässigere Erkenntnisse zu erhalten. Er erklärte, dass die ultimative Form des wissenschaftlichen Wissens die Geschichte sei. Für ihn waren diese Werke die beste Quelle, auch wenn sich die Gegenwart ständig ändere. Sorai war der Meinung, dass das Studium der Philosophie mit dem Studium der Sprache beginne. Dabei war er stark von der Schule der antiken Rhetorik der Ming-Zeit beeinflusst. Diese Bewegung sah die Qin- und Han-Periode als Modell für Prosa und die Tang-Periode als Modell für Poesie. Die Sorai-Schule führte in Selections of Tang Poetry nach Japan ein, wo sie sehr populär wurde. Es wird vermutet, dass dieses Werk von Li Panlong (李攀竜 1514-70), einem Begründer der Schule der Alten Rhetorik, herausgegeben wurde. Infolgedessen ist die Schule von Sorai heute auch als Schule der Alten Rhetorik (kobunji 古文辞) bekannt. Die Sorai-Schule betrachtete Selections of Tang Poetry hauptsächlich als ein Mittel, um Zugang zu den fünf Klassikern zu erhalten. In dieser Sichtweise unterschied sie sich von anderen konfuzianistischen Schulen. Sorai würde auch anderen Konfuzianisten in Japan, wie Hayashi Razan, vorwerfen, sich zu sehr auf Songquellen wie Zhu Xi zu verlassen.
Auch mit anderen Lehren des Song-Konfuzianismus war Sorai nicht einverstanden. Die eine lautete, dass der Weg kein vorbestimmtes Prinzip des Universums sei, sondern eine Einrichtung der Menschen: Die alten Weisen hatten ihn in den klassischen Werken des Konfuzianismus beschrieben. Diese sahen den Weg vor, der durch Riten (rei 礼) und Musik (gaku 楽) unterteilt war. Die Riten gaben soziale Ordnung, und Musik inspirierte das Herz. Dabei ermöglichte sie direkt den Fluss menschlicher Emotionen, etwas, mit dem die moralistische Philosophie des Song-Konfuzianismus nicht einverstanden war. Sorai plädierte für das Gegenteil und wollte, dass die Menschen durch Musik und Poesie bereichert werden. Er lehrte, dass man sich um die Literatur kümmern sollte, weil sie ein wichtiger Teil des menschlichen Ausdrucks sei. Infolgedessen begann das chinesische Schreiben in Japan zu gedeihen und wurde zu einer akzeptierten Kunstform. Auf diese Weise waren mehrere große Schriftsteller der chinesischen Komposition jener Zeit Anhänger seiner Schule.
Sorai war ein Unterstützer der Samurai-Klasse. Während die meisten alten Institutionen aufgrund von Führungsproblemen im Niedergang begriffen waren, waren die Samurai seiner Meinung nach am besten in der Lage, dieses Problem mit einem System von Belohnungen und Strafen zu lösen. Sorai sah damals auch Probleme mit der Kaufmannsklasse: Er beschuldigte sie der Verschwörung zur Preisbindung. Allerdings unterstützte er auch die unteren Klassen nicht. Er argumentierte: "Welchen möglichen Wert kann es für das gemeine Volk haben, wenn es über seinen eigentlichen Lebensstand hinausgeht und solche Bücher [wie die konfuzianischen Klassiker] studiert?
Meister Sorais Lehren
Master Sorai's Teachings ist eine Aufzeichnung von Sorais Lehre und seinem Austausch mit seinen Schülern. Der Text wurde von seinen eigenen Studenten redigiert und enthielt ihre Fragen, gefolgt von seinen Antworten. Das Werk wurde erst 1724 veröffentlicht, aber es wird angenommen, dass es tatsächlich um 1720 geschrieben wurde. Darin schreibt er, dass die Literatur nicht so sehr für die Unterweisung in Moral oder Staatsführung gedacht ist, sondern dass sie die menschlichen Emotionen einfach fließen lässt. Daraus können Antworten auf die erstgenannten Themen gefunden werden. Während Sorai versuchte, die Quellen der Tokugawa-Legitimität neu zu definieren, war sein Ziel eindeutig die Stärkung der Autorität des Tokugawa-Shogunats.