Der Blitzdieb
Annabeth erscheint zum ersten Mal in The Lightning Thief und ist zwölf Jahre alt. In einem Anfall von Beleidigungen erhielt sie von Percy den Spitznamen "Wise Girl". Der Name war als Beleidigung gemeint, aber jetzt ist es ein liebevoller Kosename.
Sie trifft zum ersten Mal auf Percy Jackson, nachdem er vom Minotaurus angegriffen wurde, und bahnt sich seinen Weg in den Halbbluthügel. Als er sie zum ersten Mal sah, beschrieb Percy Annabeth als "hübsch" mit blondem Haar, das "wie das von Aschenputtel" gelockt war. Nachdem Percy vom Angriff des Minotaurus geheilt ist, hört Annabeth, dass er sich auf eine Suche begeben soll, und sie will mitgehen, da sie denkt, Percy sei "der Eine" aus der Großen Prophezeiung. Gemeinsam gehen sie, Percy und Grover auf die Suche nach dem gestohlenen Blitz des Zeus. Durch das ganze Buch hindurch zeigt Annabeth ihre einzigartige Intelligenz, die sie von ihrer Mutter geerbt hat, und auch ihre Arachnophobie (Angst vor Spinnen), die sie mit allen ihren Geschwistern mütterlicherseits teilt (aus der Geschichte von Arachne und Athene)
Das Meer der Ungeheuer
Annabeth, Percy und Tyson, denen es nicht erlaubt war, sich auf die Suche nach dem Goldenen Vlies zu begeben, um Thalias Kiefer zu retten und Grover durch Chirons vorübergehenden Ersatz zu finden, schleichen sich dafür aus dem Halbblut-Lager. Während des Buches wird enthüllt, dass Annabeths größter Traum darin besteht, die ganze Welt neu zu gestalten, um sie zu verbessern, Lukas (vor sich selbst) zu retten und von ihrer Mutter und ihrem Vater akzeptiert zu werden. Nachdem sie auf der Insel der Königin-Hexe Circe gestrandet ist, rettet Annabeth Percy, nachdem er mit den Multivitaminen, die ihnen von Hermes gegeben wurden, in ein Versuchskaninchen verwandelt wurde. Während des Kampfes mit Polyphem gibt Annabeth (obwohl sie mit ihrer Yankee-Mütze unsichtbar ist) vor, ein Niemand zu sein, und lenkt ihn lange genug ab, damit Percy ihn besiegen kann. Annabeth wird während des Kampfes tödlich verletzt, wird aber mit Hilfe des Goldenen Vlieses geheilt.
Der Fluch des Titanen
Annabeth wird zusammen mit der Göttin Artemis entführt und muss von Percy, Thalia, Grover und den Jägerinnen Zoë Nightshade und Bianca di Angelo gerettet werden. In einem Traum, den Percy hat, befindet sich Annabeth auf einem Berg, und sie sieht Lukas ein schwarzes Dach hochhalten (Percy unbekannt, es ist der Himmel). Annabeth hilft ihm, es zu halten, und dann schlüpft Lukas von unten heraus und zwingt Annabeth, es zu halten. Dies wird später dazu benutzt, Artemis auszutricksen, damit sie den Himmel hält, da Artemis nicht widerstehen könnte, einem Mädchen zu helfen. Im Gegensatz zu den anderen Büchern ist Annabeths Rolle recht klein. In diesem Buch wird angedeutet, dass es für sie und Percy eine romantische Zukunft geben wird. Aphrodite, die Göttin der Liebe, überzeugte auch Percy von seinen Gefühlen für Annabeth, obwohl sie es den beiden noch schwerer machte, sich zu verlieben. Am Ende rettet Percy sowohl Annabeth als auch Artemis, während Thalia gegen Lukas kämpft, bis dieser von einer Klippe stürzt.
Die Schlacht im Labyrinth
Nach diesem Buch ist Annabeth vierzehn Jahre alt. Percy und Annabeth finden einen Eingang in das Labyrinth. Ihr wird klar, dass Lukas versuchen könnte, diesen Eingang zu benutzen, um ins Lager einzudringen.
Annabeth führt die Suche in das Labyrinth und erfüllt damit eine ihrer Ambitionen. Sie begibt sich mit Percy, Grover und Tyson in das Labyrinth, um einen Weg zu finden, Kronos' böse Kräfte daran zu hindern, in die Grenzen von Camp Halbblut einzudringen, indem sie nach dem Erfinder des Labyrinths, Daedalus, sucht. Die Prophezeiung, die das Orakel ihr gegeben hat, scheint sie erschreckt zu haben, und sie weigert sich, die letzte Zeile auszusprechen. Als sie in das Labyrinth eindringen, sehen sie sich vielen Entbehrungen gegenüber. Annabeth steht einer Sphinx gegenüber und findet die Rätsel (bei denen es sich eigentlich um Sachfragen handelt) nicht herausfordernd und eine Beleidigung für ihren Intellekt. Sie entkommen den Klauen der Sphinx und machen sich auf die Suche nach Hephaestus, damit er ihnen sagen kann, wo Dädalus zu finden ist.
Auf dem Weg zu Hephaestus' Schmiede in Mount St. Helens finden sie dort Telekines, die eine Waffe für Kronos herstellen. Percy sagt Annabeth, sie solle fliehen, solange sie noch kann. Sie küsst ihn als Glücksbringer, und ihre Wege trennen sich. Annabeth glaubt, dass er stirbt, als der Mount St. Helens ausbricht, aber das ist nicht der Fall. Percy stürzt auf die Insel Ogygia, dem Gefängnis der Nymphe Calypso, einer Tochter von Atlas. Als Percy ins Lager zurückkommt, führt Annabeth ein Begräbnisritual für ihn durch. Als sie ihn bemerkt, umarmt sie ihn und macht eine Szene. Als sie jedoch von Calypso erfährt, ist sie sehr eifersüchtig. Percy bittet dann ein sterbliches Mädchen, Rachel Elizabeth Dare, ihnen auf ihrem Weg durch das Labyrinth zu helfen (Rachel hat die seltene Fähigkeit, durch den Nebel zu sehen). Annabeth wird sehr eifersüchtig darauf, wie nahe sich Percy und Rachel kommen. Die drei entdecken Lukas, der zum Gefäß von Kronos geworden ist. Nach einer Schlacht wird Lukas in das Labyrinth zurückgedrängt und hinterlässt zwei Verletzte. Annabeth weigert sich zu glauben, dass Lukas ganz böse ist, und wird ziemlich wütend auf Percy, weil er das Gegenteil behauptet.
Nachdem sie ihre Mission erfüllt haben, stehen Annabeth und Percy auf dem Halbblutberg und stimmen ihre Ziele mit der Prophezeiung ab. Annabeth enthüllt die letzte Zeile ihrer Prophezeiung, "Eine Liebe zu verlieren, die schlimmer ist als der Tod", und ist verwirrt, nicht sicher über ihre Gefühle für Lukas oder eine heimliche Liebe für Percy. Am Ende geht sie mit ihrem Vater fort, um in San Francisco auf eine Privatschule zu gehen.
Der letzte Olympionike
Im letzten Buch erscheint Annabeth zum ersten Mal, als Percy von der Sprengung des Schiffes von Kronos, der Prinzessin Andromeda, zurückkehrt. Nach seiner Ankunft hilft Annabeth Percy, die Große Prophezeiung zu hören. Percy badet im Fluss Styx (er entkommt nur knapp, indem er sich vorstellt, wie Annabeth ihn aus dem Fluss zieht) und ruft Annabeth an und sagt ihr, sie solle ihn vor dem Empire State Building mit allen Halbgöttern aus Camp Half Blood treffen. Als Annabeth und Percy auf den Olymp gehen, treffen sie Hermes, bei dem Annabeth versucht, sich dafür zu entschuldigen, dass Lukas sich in Kronos verwandelt hat. Hermes wird wütend auf sie und wirft ihr vor, Lukas nicht gerettet zu haben. Hermes geht weg, und sie kehren zu den anderen Campern zurück, um Manhattan und den Olymp zu verteidigen. In der Schlacht versucht Ethan Nakamura, Percy in den kleinen Rücken, seinen Achillespunkt, zu stechen, und Annabeth springt vor ihm her und nimmt das Messer. Nach einigen Stunden der Ruhe geht Annabeth, obwohl sie noch immer vom Gift geschwächt ist, wieder in die Schlacht. Kronos geht zum Olymp, und Grover, Thalia, Percy und Annabeth folgen ihm. Kronos greift Percy an, und Annabeth schließt sich dem Kampf an, wird aber aus dem Kampf geschlagen, als Kronos sie auf den Thron der Athene schleudert. Am Ende rettet sie Percy und den Olymp, indem sie endlich die wahre Bedeutung der Prophezeiung erkennt. Sie überredet Percy, Lukas ihr Messer zu geben (das ihr von Lukas gegeben wurde, als sie sieben Jahre alt war), damit er sich selbst erstechen kann, sich selbst tötet und Kronos erneut in den Tartarus verbannt. Sie wird von den Göttern belohnt, die ihr erlauben, ihre Talente als Architektin für den Wiederaufbau des Olymps einzusetzen. Percy Jackson lehnt die Unsterblichkeit wegen seiner Gefühle für Annabeth ab. Im Camp Half-Blood im Speisesaal später an diesem Tag küsst Annabeth Percy, nachdem er ihr seine Gefühle für sie eingestanden hat. Sie warnt ihn, dass sie es ihm niemals leicht machen wird. Danach küssen sie sich unter Wasser, nachdem Lauscher sie in den Kanusee geworfen haben.
Magnus Chase und die Götter von Asgard
Vorlage:Hauptartikel: Magnus Chase und die Götter von Asgard
Magnus Chase und die Götter von Asgard, Buch 1 Das Schwert des Sommers
Annabeth erscheint in diesem Buch und sucht mit ihrem Vater nach ihrem Cousin Magnus.
Magnus Chase und die Götter von Asgard, Buch 2 Der Hammer des Thor
Percy erscheint am Ende des Buches, als Magnus Chase erfährt, dass er an einen Ort namens "Schiff der Toten" gehen muss. Er geht zu Annabeth und bittet sie um Tipps, wobei Annabeth zitiert: "Ich weiß nicht viel über das Meer, aber mein Freund weiß viel darüber". "Es ist Zeit, dass du Percy kennen lernst..."
Magnus Chase und die Götter von Asgard, Buch 3 Das Schiff der Toten
Am Anfang des Buches heißt das erste Kapitel "Percy Jackson tut sein Bestes, um mich zu töten". Annabeth und Percy geben Tips, wie das Meer irgendwie juckt, weil Magnus an allem nuckelt, was ins Meer kam, und sich dabei fast selbst umbringt.