Naruto Uzumaki
Der gleichnamige Protagonist, der Mitglied von Team 7 und der Jinchuriki von Kurama die Neunschwänze ist, mit dem Ehrgeiz, Hokage zu werden, um den Respekt der Dorfbewohner zu gewinnen und alle zu schützen. Im Laufe der Serie, die sich als Nachfahre von Asura Otsutsuki entpuppt, dessen Chakra und Ausdauer er geerbt hat, freundet sich Naruto mit vielen fremden und Konoha-Bürgern an und gewinnt schließlich einen beträchtlichen positiven Einfluss auf deren Leben, bis zu dem Punkt, an dem er Weltruhm erlangt. Naruto verwirklicht schließlich seinen Traum, Hokage zu werden und eine Familie mit Hinata Hyuga und ihren Kindern Boruto und Himawari zu gründen.
Sasuke Uchiha
Der Seriendeuteragonist ist ein Mitglied von Team 7 und ein überlebender Angehöriger des Uchiha-Clans, eines mächtigen Ninja-Clans, der von Indra Otsutsuki abstammt, der für seine Sharingan-Augen bekannt ist. Sasukes einziger Wunsch ist es, seinen Clan zu rächen, was ihn letztlich dazu verführt, sich gegen das Verborgene Blatt zu wenden, nachdem er bis zum Vierten Großen Ninja-Krieg die Wahrheit erfahren hatte. Durch die Ereignisse des Boruto, der seinen Arm verlor, wurde Sasuke ein umherziehender Vigilant, der den Einfluss des Otsutsutsuki-Clans auf die Welt untersuchte und gleichzeitig Konohagakure unterstützte.
Sakura Haruno
Eine Freundin von Naruto und ein weibliches Mitglied von Team 7, das als Sanitätsninja der Gruppe diente, nachdem es von Tsunade trainiert worden war. Sakura war anfangs in Sasuke verliebt, während sie Naruto übelwollte. Nach und nach betrachtete sie Naruto als einen Freund, heiratete schließlich Sasuke und zog ihre Tochter Sarada auf.
Kakashi Hatake
Der Anführer und Sensei von Team 7/Team Kakashi, der zuvor Schüler des Minato von Narutos Vater war und eine Sharigan von seinem Teamkollegen Obito Uchiha erwarb. Nach dem Vierten Großen Ninja-Krieg wurde Kakashi der Sechste Hokage und regierte Konoha viele Jahre lang, bevor er zu Narutos Gunsten abdankte.
Sai
Ein Ninja, der Sasukes Platz im Team Kakashi in Teil II einnimmt und in der Lage ist, seine Zeichnungen zum Leben zu erwecken. Sai wurde vom Aufseher der Stiftung, Danzo Shimura, zunächst zu einem emotionslosen Dröhnen erzogen und beginnt, sozialer zu werden, während er, Naruto und Sakura eine Verständigung erreichen. Im Epilog der Serie heiratet Sai schließlich die Yamanaka und zieht seinen Sohn Inojin an der Seite seiner Frau Ino auf.
Yamato
Ein ANBU-Mitglied, das im Team Kakashi eine zweite Führungsrolle übernimmt, verlor seine ursprüngliche Identität, als Orochimaru als Kind mit ihm experimentierte, um den Holzstil von Hashirama nachzubilden. Aufgrund des Besitzes von Hashiramas Zellen erwies sich Yamato bei der Unterwerfung der Neunschwänze als unerlässlich, wann immer Naruto im Begriff ist, vom Schwanztier-Chakra verzehrt zu werden.
Dorf mit versteckten Blättern
Iruka Umino
Ein Ausbilder an der Ninja-Akademie, der als Kind seine Eltern an Kurama verlor, was dazu führte, dass er sich trotz der Entscheidung des Dritten Hokage aufgrund ihres ähnlichen Hintergrunds als Narutos Lehrer unbehaglich fühlte. Iruka war schließlich die erste Person, die Naruto anerkannte, und wurde für den Jungen zu einer Vaterfigur.
Konohamaru Sarutobi
Der Enkel des Dritten Hokage, der Naruto als Mentor in seinem Bestreben, Hokage zu werden, zur Seite steht. Er ahmt seine Arbeitsmoral, seine Entschlossenheit und sein charakteristisches Jutsu wie das Rasengan und das Sexy Jutsu unter einer Vielzahl anderer Techniken nach. Konohamaru besteht jedoch darauf, dass er erst dann Hokage wird, wenn Naruto zuerst Hokage geworden ist. Durch die Ereignisse des Serienepilogs ist Konohamaru in den Rang eines Jonin aufgestiegen und zu einem Mentor von Narutos Sohn Boruto geworden.
Hinata Hyuga
Einer von Narutos Freunden und ein Mitglied des Hyuga-Clans, eines mächtigen Ninja-Clans, der von Hamura Otsutsuki abstammt und für seine Byakugan-Augen bekannt ist. Obwohl sie die erstgeborene Tochter des Haupthauses war, führte Hinatas Schüchternheit und Unfähigkeit, für sich selbst einzutreten, dazu, dass sie von ihrem Vater Hiashi verstoßen und durch ihre jüngere Schwester Hanabi ersetzt wurde. Hinata wurde seitdem in die Obhut von Kurenai Yuhi gegeben und wurde neben Kiba Inuzaka und Shino Abarame als Mitglieder von Team 8 ihre Gennin-Schülerin. Nach und nach entwickelte Hinata auch Gefühle für Naruto, dessen eigene Entschlossenheit sie dazu brachte, Vertrauen in sich selbst zu gewinnen, bevor sie ihm schließlich ihre Liebe zu ihm gestand. Hinata heiratet Naruto und sie bekommen zwei Kinder nach dem Serienepilog.
Mannschaft Asuma
Das zuvor als Team 10 bekannte Team besteht aus dem Sohn des dritten Hokage, Asama Sarutobi, und seinen drei Schülern Shikamaru Nara, Sakuras Rivalen Ino Yamanaka und Choji Akimichi. Shikamaru und seine Freunde sind auch die derzeitigen Erben des Spitznamens "Ino-Shika-Cho", wobei ihre Clans enge Verbündete sind. In Teil II wird Asuma von dem Akatsuki-Mitglied Hidan getötet, während Shikamaru seinen Mentor rächt, der zum Anführer der Gruppe wird. Im Epilog der Serie, in dem sein Versprechen eingelöst wird, sich um Asumas Tochter Mirai Sarutobi zu kümmern, heiraten Shikamaru und seine Freunde und ziehen ihre Kinder Shikadai Nara, Chocho Akimichi und Inojin Yamanaka als nächste "Ino-Shika-Cho"-Gruppe auf.
Mannschaft Guy
Ein Ninja-Team, bestehend aus Kakashis Rivalen Might Guy und seinen drei Schülern Rock Lee, Hinatas Cousine Neja Hyuga und Tenten. Sie sind ein Jahr älter als der andere Hidden Leaf Gennin, da Guy ein Jahr warten wollte, bevor sie den Test ablegen konnten, um im Ninja-Rang aufzusteigen und Chunin zu werden. Am Ende der Serie opferte sich Neji, um Naruto und Hinata zu retten, während der kreisförmige Schaden, den Guy bei seinem letzten Angriff erlitt, ihn in den Vorruhestand zwang.
Jiraiya
Narutos Mentor und einer der drei legendären Sannin, die Schüler des Dritten Hokage, die die Schande erlangten, dass sie den Hanzo des Salamanders des Verborgenen Regens in der Schlacht überlebt haben. Er ist auch als "Kröten-Salbei" bekannt, weil er Salbei-Jutsu von den Straßen des Berges Myobu gelernt hat, nachdem ihm der Älteste gesagt hatte, dass sein Schüler ein Retter der Welt werden würde, und auch als "perverser Salbei" von Naruto, weil er der offen lüsterne Autor einer Reihe von Bestseller-Romanen für Erwachsene war. Er schrieb auch das Epos "Tale of the Gutsy Ninja", dessen Protagonist Naruto nach ihm benannt wurde. In Teil I nahm Naruto Naruto als seinen Schüler auf, bevor er ihn in Teil II verließ, um die Akatsuki zu untersuchen und zu lernen, sie von seinem ehemaligen Schüler Nagato zu leiten. Jiraiya stirbt kämpfend, während er eine Botschaft sendet, um dem Verborgenen Blatt eine Chance gegen Nagato zu geben, da er glaubt, Naruto sei das Kind der Prophezeiung der Älteren Kröte.
Hokage
Der Begriff Hokage bezieht sich auf den Titel des Anführers von Konohagakure, mit insgesamt sieben durch die Serie hindurch, deren Bildnisse in die Felsformation über Konohagakure getrieben sind.
- Hashirama Senju, der Erste Hokage, war Mitbegründer von Konohagakure und ehemaliger Anführer des Senju-Clans. Nachdem er die Zeit der kriegführenden Staaten in seiner Kindheit am eigenen Leib erlebt hatte, wollte Hashirama den Konflikt beenden und schmiedete eine Freundschaft mit Madara Uchiha, bevor die Jugend sie zu Feinden erklärte. Später überzeugte Hashirama Madara, ihre Clans Frieden schließen zu lassen und gleichzeitig Konoha zu finden. Hashirama starb später und wurde durch die Serie zweimal von Orochimaru wiederbelebt.
- Tobirama Senju, der Zweite Hokagem, ist Hashiramas jüngerer Bruder und der Lehrer von Hiruzen Sarutobi, der als der Hokagem angesehen wurde, der die Infrastruktur des Verborgenen Blattes zusammen mit verschiedenen Jutsu schuf, darunter das Schattenklon-Jutsu und das umstrittene Reanimations-Jutsu, dem er schließlich von Orochimaru unterworfen wurde.
- Hiruzen Sarutobi, der dritte Hokage, ist der erste Hokage, der in dieser Serie eingeführt wurde. Während der gesamten Serie fungiert er als eine Quelle der Weisheit für die jüngeren Generationen; und er ist von Anfang an einer der wenigen Charaktere, die Naruto als Person und nicht als Jinchuriki behandeln. Er ist auch der Mentor des legendären Sannin, der von seinem eigensinnigen Schüler getötet wurde, während er das Todessiegel des Schnitters benutzte, um seine Seele und seine drei Vorgänger zusammen mit einem Teil von Orochimarus Seele im Magen des Schnitters einzufangen. Während des Vierten Großen Ninja-Krieges befreit Orochimaru Hiruzens Seele aus dem Todessiegel und reanimiert ihn, damit Sasuke die Ereignisse hinter dem Massaker des Uchiha-Clans bestätigen kann. Später nimmt er an der Seite des anderen wiederauferstandenen Hokage am Kampf gegen Obito und Madara teil, bevor er nach der Niederlage Kaguyas zur Ruhe gesetzt wird.
- Minato Namikaze, der Vierte Hokage, ist Naruto Uzumakis Vater, der auch Kakashis Lehrer und Jiraiyas Schüler ist, der Tobiramas Flying Thunder God-Teleportation Jutsu perfektionierte. Vor Beginn der Serie, nachdem er gegen Tobi gekämpft hat, saugt Minato Kuramas Yin-Chakra ab, um die Bestie zu schwächen und sie in einem Opferakt in Narutos Körper einzusperren, so dass nur sein Sohn Zugang zum Yang-Chakra der Neunschwänze erhält. Jahre später wurde Minato als Neunschwanz-Jinchuriki von Orochimaru wiederbelebt, vereinigte sich wieder mit Naruto und übertrug schließlich das Neunschwanz-Yin-Chakra auf seinen Sohn, bevor er ins Jenseits zurückkehrte.
- Tsunade, der Fünfte Hokage, ist der Hokage für den größten Teil der Serie. Er ist eine Erscheinung des Dritten Hokage und Mitglied des Senju-Clans durch ihren Großvater Hashirama, der über übermenschliche Kräfte besitzt und eine Verwandlungstechnik anwendet, um ihr jugendliches Aussehen zu erhalten. Tsunade wollte ursprünglich nichts mit den Hokage zu tun haben, da ihr jüngerer Bruder Nawaki und ihr Freund Dan Kato beide bei der Verwirklichung dieses Traums starben. Doch nach der Begegnung mit Naruto Uzumaki gewinnt sie ihren Glauben zurück und wird Hokage, während sie ihre Fähigkeiten an Sakura und Ino weitergibt. Am Ende der Serie geht Tsunade am Ende des Vierten Großen Ninja-Krieges in den Ruhestand und verleiht Kakashi den Hokage-Titel.
Danzo Shimura
Ein Bewohner von Hidden Leaf, der der Anführer der Stiftung ist, einer Geheimorganisation, die insgeheim die Sicherheit ihres Dorfes zusammen mit seinem persönlichen Ziel, ein Hokage zu werden, überwacht. Nachdem er Hiruzen und seine Nachfolger als willensschwach angesehen hatte, verursachte Danzos Aktion zahlreiche Ereignisse, darunter das Massaker von Uchiha, bei dem Orochimaru angeworben wurde, um seinen rechten Arm mit mehreren Sharingan-Augen und Hashirama-Zellen zu vergrößern. Obwohl Danzo während des Tsunade-Koms zum sechsten Hokage-Kandidaten ernannt wurde, wurde er schließlich von Sasuke tödlich verwundet und starb, was zur Auflösung der Stiftung nach dem Vierten Großen Ninja-Krieg führte.
Antagonisten
Sabuza Momotschi
Einer von Narutos ersten Gegnern und ehemaliges Mitglied der Hidden Mist's Seven Swordmen of the Mist, einer Gruppe von Ninja, die im Kampf besonders große Schwerter einsetzen. Berüchtigt dafür, seine ganze Klasse im Rahmen eines Graduierungsrituals abzuschlachten, besitzt Zabuza ein großes Schwert namens "Klinge des Henkers", das sich selbst reparieren kann, indem es das Eisen aus dem Blut absorbiert. Zabuza und sein Lehrling Haku, ein Besitzer des Kekkei Genkai im Eisstil, enden nach einem gescheiterten Staatsstreich der Vierten Mizukage als Schurken-Ninja und werden zu Söldner-Attentätern, um einen weiteren Versuch unter der Beschäftigung eines Verbrecherbosses namens Gato zu finanzieren. Doch das Treffen mit Team 7 und der Verrat durch Gato führten zum Tod von Zabuza, als er und Haku während des Vierten Großen Ninja-Krieges von Kabuto wiederbelebt wurden.
Orochimaru
Ein Verbrecher, der als Hauptschurke von Teil I diente, Hiruzens eigensinniger Schüler, der sich zuvor den Akatsuki anschloss und sich mit Danzo verband. Orochimarus Wunsch nach Unsterblichkeit, damit er jedes existierende Justu lernen kann, veranlasste ihn dazu, an seinen Ninja-Kollegen zu experimentieren, bevor er sein eigenes Ninja-Dorf, das Hidden Sound Village, als sein persönliches Laboratorium gründete, um seine Arbeit fortzusetzen und gleichzeitig eine persönliche Armee aufzubauen, mit der er Konoha zerstören wollte. Zu seiner Unsterblichkeitstechnik gehört es, sein Bewusstsein alle paar Jahre zwischen verschiedenen Wirtskörpern zu transferieren, wobei seine Absicht, den Körper von Sasuke Uchiha zu erwerben, seine treibende Motivation während des größten Teils der Serie war. Nach dem Ende von Teil II verzichtete Orochimaru auf seinen persönlichen Krieg gegen das Dorf der verborgenen Blätter, während er Mitsuki schuf.
Kabuto Yakushi
Orochimarus rechte Hand und Spionin, die im medizinischen Ninjutsu gut genug ist, um Zellen zu manipulieren. Kabuto war ursprünglich ein Infiltrator der Stiftung, der keine Erinnerung an seine Vergangenheit hatte und von Orochimaru aufgenommen wurde, als Danzo ihn als Sicherheitsrisiko betrachtete. Kabuto nutzt seine Fähigkeiten, um im Auftrag von Orochimaru Informationen über verschiedene Gruppen zu sammeln. Nachdem Orochimaru unterworfen wurde, beschließt Kabuto, Herr seines Schicksals zu werden, indem er das Schlangensalbei-Jutsu beherrscht und gleichzeitig einige von Orochimarus Überresten zusammen mit DNA-Proben von Sound Five, Jugo, Suigetsu und Karin in seinen Körper integriert. Kabuto perfektioniert auch das Reanimations-Jutsu, indem er ein Bündnis mit Tobi mit Sasuke als Bezahlung für seine Oberflächen erzwingt. Aber Kabuto wird am Ende besiegt und bewertet seine Lebensentscheidungen neu, als er beschließt, Sasuke zu retten. Nach dem Krieg kehrte Kabuto, der von der Hidden Leaf unter Beobachtung gehalten wurde, zurück, um das Waisenhaus zu leiten, in dem er als Kind zusammen mit seinem Adoptivbruder Urushi untergebracht war.
Itachi Uchiha
Ein rougefarbener Hidden Leaf-Ninja, der sich den Akatsuki anschloss, nachdem er seinen Clan abgeschlachtet hatte, nachdem er als Schurke dargestellt worden war. Doch nach seinem Tod stellt sich heraus, dass Itachi dem Verborgenen Blatt treu war und seine Familie erst dann tötete, als sie drohte, auf Befehl von Danzo einen Staatsstreich zu versuchen, wobei Tobi ihm assistierte. Itachi nimmt die Aufgabe unter der Bedingung an, dass Sasuke verschont wird, da er geplant hat, dass Sasuke ihn töten soll. Itachi bewahrt seine Loyalität gegenüber dem Verborgenen Blatt, indem er heimlich die Akatsuki ausspioniert, wobei er Kisame als Mitglied zur Seite steht.
Akatsuki
Die primäre antagonistische Kraft des zweiten Teils der Naruto-Serie wurde von Jiraiyas Schülern Yahiko, Nagato und Konan als Friedenstruppe im Verborgenen Regen gegründet, bevor eine von Danzo orchestrierte Tragödie es Tobi erlaubte, sie als angeheuerte Söldner, die von Schurken-Ninja kompromittiert wurden, umzubenennen. Die Akatsuki, bei denen Nagato jetzt ein Anführer ist, der davon ausgeht, dass es ihr Ziel ist, alle dazu zu zwingen, das Leiden um des wahren Friedens willen zu verstehen, handeln nach Madaras Projekt Tsuki no Me (Mondauge), um die Schwanztiere an die Gedo-Statue zu verfüttern und einen Unendlichen Tsukiyomi zu gießen, um die gesamte Menschheit zu unterwerfen.
- Nagato, vor allem bekannt unter dem Decknamen Pain mit den ihm als Kind implantierten Augen von Madara, ist die Galionsfigur des Akatsuki und Partner von Konan. Der "Schmerz", der am häufigsten in der Serie gesehen und verwendet wird, ist der Deva-Pfad, der in Wirklichkeit die Leiche von Nagatos verstorbenem Freund Yahiko ist, der zusammen mit ihnen und Konan als Kriegswaisen, die Ninjutsu von Jiraiya gelernt haben, der Gründungsführer der Akatsuki war. Nachdem er nach Yahikos Tod zum Krüppel wurde, benutzt Nagato sechs modifizierte Leichen, die als die Sechs Pfade des Schmerzes bekannt sind, als Stellvertreter, von denen jeder ein Sechstel seiner vollen Kraft einsetzt. Nachdem er Jiraiya getötet hatte, führte Nagato einen Angriff auf das Verborgene Blatt an, bei dem Naruto seine Pfade besiegte und es ihm gelang, Nagatos Glauben an Jiraiyas Lehren wiederherzustellen, während er sich selbst opfert, um einen Jutsu Tobi zu benutzen, der für Madaras Auferstehung bestimmt war. Tobi entweiht später Nagatos Ruhestätte, um das Rinnegan zu erwerben, das Madara später zurückfordert, wobei Kabuto Nagato für den Vierten Großen Ninja-Krieg wiederbelebt, bevor er von Itachi versiegelt wird.
- Konan, das einzige weibliche Mitglied des Akatski und Nagatos Jugendfreund. Während ihrer Zeit unter Jiraiya lernte Konan, ihr natürliches Talent im Umgang mit Origami auszunutzen und es als Schlüsselkomponente ihres Kampfstils einzusetzen. Nach Nagatos Tod zieht Konan ihre Position von Akatsuki zurück und kämpft später gegen Tobi, als dieser auf die Augen von Rinnegan kommt, der schließlich nach dem Scheitern ihres selbstmörderischen Angriffs getötet wird.
- Kisame Hoshigaki, ein abtrünniger Ninja aus dem Hidden Mist Village, der mit Itachi Uchiha zusammenarbeitet. Als einer der Sieben Schwertkämpfer des Nebels verwendet Kisame ein lebendiges Schuppenschwert namens Haifischhaut, das ungezählte Mengen des Chakras des Gegners aufnimmt und auf Kisame überträgt, um ihm unendlich viel Ausdauer zu verleihen. Er schloss sich den Akatsuki an, um eine Welt ohne Lügen zu sehen. Später verfolgte er Killer Bee, bevor seine Mission sich in Infiltration änderte, bevor er bei der Gefangennahme Selbstmord begeht, während er Tobi den Aufenthaltsort der Jinchurikis übermittelt.
- Sasori, ein abtrünniger Hidden-Sand-Marionetten-Ninja, der aufgrund seines Talents in der Giftherstellung als "Sasori des Roten Sandes" bekannt ist. Sasori wurde von seiner Großmutter Chiyo aufgezogen, nachdem seine Eltern von Kakashis Vater Sakumo Hatake getötet worden waren. Sasoris Besessenheit, Dinge herzustellen, die für immer halten, ermöglichte es ihm, ein Mittel zu entwickeln, mit dem er menschliche Leichen in Marionetten verwandeln kann, deren Fähigkeiten er im Leben nutzen kann. Sasoei verließ sein Dorf, entführte den Dritten Kazekage und machte ihn zu seiner Hauptwaffe, nachdem er seinen Eisensand mit Gift versetzt hatte. Später verwandelte Sasori seinen eigenen Körper in eine Marionette, die in seinem gepanzerten Körper die Marionette Hiruko verbirgt, und wurde im Wesentlichen sterblich, während er Hunderte von Marionetten auf einmal kontrollierte. Nachdem er sich den Akatsuki angeschlossen hatte, wurde Sasori mit Orochimaru und dann mit Deidara verbündet, als sie Gaara gefangen nahmen, damit der Eine Schwanz aus ihm herausgezogen werden kann. Doch Sasori wird schließlich getötet, sein Marionettenkörper wird von Kankuro benutzt.
- Deidara, ein abtrünniger Hidden Stone Ninja, der seinen Lebensunterhalt als terroristischer Auftragsbomber mit seinen Tonsprengstoffen verdiente, bevor Itachi Uchiha ihn zwang, sich den Akatsuki anzuschließen. Obwohl er sich der Organisation anschloss, sich mit Sasori und dann mit Tobi zusammentat, entwickelte Deidara einen Groll gegen den Uchiha-Clan im Allgemeinen, da er das Gefühl hatte, dass ihre Sharingan-Augen auf seine Kunstwerke herabblickten. Nachdem er bei der Gefangennahme von Gaara und der Gefangennahme der Drei Schwänze eine Rolle gespielt hatte, kämpft Deidara gegen Sasuke und sprengt sich schließlich selbst in die Luft, um seinen Gegner endgültig zu töten. Deidera wird später während des Vierten Großen Ninja-Krieges von Kabuto wiederbelebt, bevor sie von Kankuro besiegt wird.
- Hidan, ein sadomasochistischer Rouge-Ninja aus dem Hidden Boiling Water Village, der mit einer Sense bewaffnet ist und sich mit Kakuzu verbündet hat. Als Mitglied eines Todeskults, der als "Way of Jashin" bekannt ist, wurde Hidan unsterblich, während er ritualistische Techniken entwickelte, die es ihm erlauben, seinen Gegner zu ermorden, indem er sich selbst tödliche Verletzungen zufügt. Hidan wurde ein Feind von Shikamaru, nachdem er Asama ermordet hatte. Am Ende wurde er zerstückelt und im Familienwald der Nara begraben.
- Kakuzu, ein Rouge-Ninja aus dem Dorf Hidden Waterfall und Partner von Hidan. Kakuzu, der während der Zeit des Ersten Hokage lebte, beherrschte ein verbotenes Jutsu, das seinen Körper durch schwarze Drohungen zusammenhält und bis zu fünf Herzen assimiliert, um sein Leben auf unbestimmte Zeit zu verlängern. Während er aus Habgier als Schatzmeister und Kopfgeldjäger des Akatsuki dient, tötete er die Mehrheit seiner Partner, bevor er mit dem unsterblichen Hidan verbündet wurde. Kakuzus Herzen werden während seines Kampfes gegen die Hidden Leaf-Ninja systematisch zerstört, wobei Kakashi ihm den Garaus macht, nachdem Naruto sein letztes Herz am Rande des Scheiterns hinterlässt. Kakuzu wird später während des Vierten Großen Ninja-Krieges wiederbelebt, bevor er versiegelt wird.
Obito Uchiha
Auch als Tobi bekannt, ist er der wahre Hauptantagonist des Akatsuki-Führers für den größten Teil von Teil II. Ähnlich wie Naruto als Kind während des Dritten Großen Ninja-Krieges gab er seinem Teamkollegen Kakashi sein linkes Auge, als es so aussah, als würde er bald sterben. Trotz seines scheinbaren Ablebens wurde Obito von Madara gerettet, der die beschädigten Körperteile durch Zetsu-Prothesen ersetzte, während er ihn zu seinem Lehrling konditionierte. Der Ninja arrangierte, dass Obito Zeuge des Todes Rin Noharas als Kriegsopfer durch einen widerwilligen Kakashi wurde, der seinen Geist brechen wollte. Obito kam zu dem Schluss, dass er mit Hilfe der Schwanztiere die gegenwärtige Realität zerstören und eine Utopie erschaffen kann, und greift Madaras Namen auf. Er manipulierte Ereignisse, die die Entstehung der Strömung von Akatsuki und den Angriff der Nine Tails auf das Hidden Leave Village ermöglichten, aus Trotz gegenüber seinem ehemaligen Mentor Minato. Abgesehen davon, dass er mit seinem rechten Sharingan Kamui so manipulieren konnte, dass es schien, als sei er nicht greifbar und über große Entfernungen teleportieren zu können, kann Obito auch Angriffe im Holzstil einsetzen, da seine Prothesen die Zellen von Hashirama besitzen. Nachdem er besiegt und sein Vertrauen in die Welt wiederhergestellt und den Sharingan, den er Kakashi gegeben hatte, zurückgewonnen hat, stirbt Obito beim Schutz von Team 7 vor Kaguya und bleibt lange genug unter den Lebenden, um Kakashi im Geiste zu helfen.
Madara Uchiha
Als einer der Mitbegründer des Hidden Leaf Village zusammen mit seinem Jugendfreund und Todfeind Hashirama Senju entpuppten sich die beiden später als Reinkarnationen der Gründungsvorfahren ihrer Clans, Indra und Asura vor Sasuke und Naruto. Madara ist ein rachsüchtiger und arroganter Zyniker, der es den Senju übel nahm, dass sie seine Brüder während der Zeit der kriegführenden Staaten töteten, und der schließlich Hashiramas Friedensangebot annahm, bevor er schließlich von ihm enttäuscht wurde, da er erkannte, dass er im Dorf der verborgenen Blätter keinen Platz hatte. Dies beeinflusste Madara dazu, den Versuch zu unternehmen, das Verborgene Blatt mit den Neunschwänzen zu zerstören, bevor er von Hashirama besiegt wurde. Er täuschte seinen Tod vor und benutzte Hashiramas Blut, um seinen Rinnegan zu wecken und die Gedo-Statue zu beschwören, um sein Leben zu verlängern. Madara stirbt schließlich, nachdem er Obito Uchiha zu seinem Agenten gemacht hat, nachdem er seinen Rinnegan nach Nagato verpflanzt hatte, um ihn für seine geplante Auferstehung zu konservieren. Trotz einiger Rückschläge erwacht Madara wieder zum Leben und macht sich selbst zum Zehn-Schwanz-Jinchuriki, um seinen Plan auszuführen, bevor er von Black Zetsu verraten und zu einem Gefäß für Kaguya gemacht wird. Obwohl er nach der Wiederversiegelung Kaguyas befreit wurde, brachte die Tortur einen bedauernswerten Madara an den Rand des Todes und stirbt schließlich beim Friedensschluss mit Hashirama.
Kaguya Otsutsuki
Der zentrale zugrunde liegende Antagonist der Naruto-Serie und Mitglied der Hauptfamilie des Otsutsutsuki-Clans, einer Rasse außerirdischer Ninja, zu deren Nachfahren die Senju, die Uchiha und die Hyuga gehören. Kaguya hat sich entschieden, die Welt zu beschützen, anstatt sich wie ihre Verwandten von ihr zu ernähren, und wird zu einer Erweiterung des göttlichen Baumes der Welt, als sie ihr Ideal des Weltfriedens begründete. Aber Kaguya verliert schließlich das Vertrauen in die Menschheit, als sie einige Menschen, die vom Göttlichen Baum assimiliert wurden, zur Verteidigung gegen ihre Verwandten in ihre persönliche Armee des Weißen Zetsu bekehrt, was zu einer Konfrontation mit ihren halbmenschlichen Zwillingssöhnen Hagoromo und Hamura führt, als sie erfährt, dass sie ihr Chakra geerbt haben. Kaguya verschmolz schließlich mit dem Göttlichen Baum und verwandelte ihn in den Zehn-Schwänze-Baum, bevor sie im Mond versiegelt wurde, als sie von Hagoromo gefangen genommen und zur leichenähnlichen Gedo-Statue reduziert wurde, während ihr extrahiertes Chakra in die neun Schwanztiere zersplittert wurde. Aber Kaguya erschuf Black Zetsu in letzter Sekunde, um ihre Rückkehr durch Indra und den Uchiha-Clan zu orchestrieren, wobei Madara Uchiha schließlich ihr Gefäß wurde, das einst ihren Zweck erfüllte. Doch Naruto und Sasuke schaffen es mit Hilfe ihres Teams, Kaguya mit den Schwanztieren und Madara, die aus ihrem Körper herausgezogen wurde, wieder zu versiegeln.
- Zetsu, das einzige unmenschliche Mitglied der Akatsuki, das als ihr Spion dient und damit betraut ist, verstorbene Akatsuki-Mitglieder oder solche, die die Organisation nicht gefunden haben will, zu entsorgen. Zetsu besteht eigentlich aus zwei Wesen, wobei das erste ein schattenartiger Symbiont ist, der als Schwarzer Zetsu bekannt ist und von Kaguya geschaffen wurde, um ihren Enkel Indra und seine Nachkommen zu manipulieren, bevor Madara einen Rinnegan manifestierte, der als Mittel zur Befreiung Kaguyas dienen sollte. Schwarze Zetsu täuschten Madaras Konstrukt vor, während sie an einen Weißen Zetsu gebunden waren, einen der Tausenden von ehemaligen Menschen, die innerhalb der Gedo-Statue als pflanzenähnliche Drohnensoldaten assimiliert worden waren. Nachdem Weißer Zetsu während des Vierten Großen Ninja-Krieges von Sasuke getötet wird, verbündet sich Schwarzer Zetsu schließlich mit Obito und dann mit Madara, bevor er mit Kaguya eingeschlossen wird.
- Tobi, auch als "Gurguru" bekannt, ist ein weißer Zetsu, der Obito bei der Bewältigung seines neuen Körpers als Exoskelett diente und als Inspiration für Obitos Tobi-Gewand diente. Tobi nimmt am Vierten Großen Ninja-Krieg teil, indem er Yamato einhüllt, um Zugang zu seinem Holzstil zu erhalten, bevor er ihn hinauswirft, sobald Madara den Unendlichen Tsukiyomi gießen kann. Zuletzt wurde er gesehen, wie er nach dem Abbruch des Jutsu zerbröckelt, wobei sein ehemaliger Gefangener der einzige Zeuge seines Todes ist.