Methanogene sind Mikroorganismen, die unter anoxischen Bedingungen Methan als metabolisches Nebenprodukt produzieren. Die Organismen sind Archaeen, eine andere Domäne als die Bakterien. Sie kommen häufig in Feuchtgebieten vor, wo sie Sumpfgas produzieren.
Methanogene sind auch im Verdauungstrakt von Tieren wie Wiederkäuern und Menschen weit verbreitet. Methan wird häufig ausgestoßen.
In marinen Sedimenten entsteht Methan, wenn die Sulfate niedrig sind. Dies geschieht unterhalb der oberen Schichten. Methanogene Archaepopulationen spielen eine wichtige Rolle bei der anaeroben Abwasserbehandlung. Einige Methanogene sind extremophil und kommen in Umgebungen wie heißen Quellen und unterseeischen hydrothermalen Schloten sowie im "festen" Gestein der Erdkruste, Kilometer unter der Oberfläche, vor.
Methanogene wandeln Essigsäure in einem Gärungsprozess in Methan um. Verwechseln Sie sie nicht mit Methanotrophen, die Methan für ihren Kohlenstoff- und Energiebedarf verbrauchen.