Der San Joaquin River ist einer der beiden großen Flüsse Kaliforniens in den Vereinigten Staaten. Mit einer Länge von 330 Meilen (530 km) ist er nach dem Sacramento River der zweitlängste Fluss Kaliforniens. Er beginnt im Westen in den Bergen der Sierra Nevada und fließt nach Westen und Norden bis zu seinem Ende in der Bucht von San Francisco, im Sacramento-San Joaquin-Delta. Sein Becken, das etwa 32.000 Quadratmeilen (82.879 Quadratkilometer) groß ist, enthält hauptsächlich Ackerland. Der Fluss versorgt über 22 Millionen kalifornische Bürger mit Trinkwasser. Seine drei größten Nebenflüsse sind der Merced, der Tuolumne und der Stanislaus.
Der Fluss war einst eines der reichsten Flussökosysteme Kaliforniens. Heute ist der Fluss jedoch auf einer Länge von über 97 km (60 Meilen) trocken, außer bei Überschwemmungen, da viel Wasser zur Bewässerung abgeführt wurde. Unterhalb des Friant-Staudamms, einem in den 1940er Jahren errichteten Damm am San Joaquin River, sind 95 Prozent des Flusses trocken. Ein großer Teil des Flusses ist verschmutzt und zerstört die historische Population des Chinook-Lachses, der einst der südlichste in den Vereinigten Staaten war. Pestizide, Selen und viele weitere giftige Stoffe werden vom San Joaquin in die Bucht von San Francisco transportiert.
Nun wurde eines der größten Projekte im amerikanischen Westen zur Wiederherstellung des San-Joaquin-Flusses in Angriff genommen. Am 13. September 2006 unterzeichnete der Rat zur Verteidigung der natürlichen Ressourcen ein Abkommen mit den Nutzern des Friant-Staudamms und dem Innenministerium der Vereinigten Staaten. Diese Vereinbarung sieht vor, den San Joaquin-Fluss unterhalb des Staudamms wiederherzustellen und so die Verschmutzung zu verringern.
