Zilie

Nichtbewegliche (oder primäre) Zilien kommen gewöhnlich einmal pro Zelle vor; fast alle Säugetierzellen haben ein einziges nichtbewegliches primäres Zilien. Darüber hinaus finden sich Beispiele spezialisierter primärer Flimmerhärchen in menschlichen Sinnesorganen wie dem Auge und der Nase:

• Das äußere Segment der Stäbchenphotorezeptorzelle im menschlichen Auge ist mit seinem Zellkörper durch ein spezialisiertes nicht-bewegliches Zilium verbunden.
• Der dendritische Knopf des Riechneurons, in dem sich die Geruchsrezeptoren befinden, enthält ebenfalls nicht-bewegliche Zilien (etwa 10 Zilien pro dendritischem Knopf).

Die Zilien sind strukturell fast identisch mit der viel größeren Geißel. So sehr, dass vorgeschlagen wurde, dass Protisten, die eine von beiden tragen, im Phylum Undulipodia vereinigt werden sollten. Zuvor hatte Margulis vorgeschlagen, dass die Ciliaten allein in einer Phylum Ciliophora untergebracht werden sollten. Zugegeben, die Protista ist eine Ansammlung von disparaten einzelligen Formen, aber während eine ausgefeiltere Taxonomie im Fluss (im Wandel) ist, ist Protista immer noch ein nützlicher Begriff.

Flimmerhärchen und Geißeln sind Zellorganellen, spezialisierte Einheiten, die genau definierte Funktionen wie Mitochondrien und Plastiden ausüben. Es ist heute ziemlich sicher, dass alle oder die meisten dieser Organellen ihren Ursprung in einst unabhängigen Prokaryonten (Bakterien oder Archaeen) haben und dass die Eukaryontenzelle eine "Gemeinschaft von Mikroorganismen" ist, die in einer "Vernunftehe" zusammenarbeiten.