Cyanobakterien sind ein Taxon von Bakterien, die Photosynthese betreiben. Sie sind keine Algen, obwohl sie früher Blaualgen genannt wurden. Es ist ein Bakterienstamm mit etwa 1500 Arten. In der Endosymbionten-Theorie stammen die Chloroplasten (Plastiden) von den Cyanobakterien ab. Ihr DNA-Profil ist ein Beweis dafür.
Cyanobakterien haben eine extrem lange fossile Geschichte, die vor mindestens 3.500 Millionen Jahren begann. Sie waren die Hauptorganismen in den Stromatolithen des Archäischen und Proterozoischen Äons.
Die Fähigkeit der Cyanobakterien, eine sauerstoffhaltige Photosynthese durchzuführen, ist hoch signifikant. Die frühe Atmosphäre auf der Erde war weitgehend reduzierend, d.h. ohne Sauerstoff. Die Cyanobakterien in Stromatolithen waren die ersten bekannten Organismen, die Photosynthese betrieben und freien Sauerstoff produzierten. Nach etwa einer Milliarde Jahren begann die Wirkung dieser Photosynthese eine gewaltige Veränderung in der Atmosphäre. Dieser Prozess, das so genannte Große Oxygenierungsereignis, dauerte sehr lange. Schließlich tötete er die meisten Organismen ab, die nicht in Sauerstoff leben konnten, und führte zu der Art von Umwelt, wie wir sie heute kennen, in der die meisten Organismen Sauerstoff nutzen und benötigen.
