Das Gefängnis, das ursprünglich für Hunderte von Insassen ausgelegt war, bestand aus einem alten Backsteingebäude, das von einer 15 Fuß hohen und einer 30 Fuß hohen Mauer umgeben war, einer 10 Fuß hohen Mauer mit elektrifiziertem Draht, gefolgt von einer Mauer aus Stacheldraht. Darüber hinaus besetzten einige der sechzig Soldaten, die Wachdienst hatten, rund um die Uhr neun mit Maschinengewehren bewaffnete Wachtürme. Aufgrund der Anzahl der verfügbaren Zellen wurde zwischen den Zellen der Gefangenen eine leere Zelle gelassen, um zu verhindern, dass die Gefangenen im Morsekode kommunizieren konnten. Andere verbleibende Zellen im Flügel wurden für andere Zwecke vorgesehen, wobei eine Zelle für die Gefängnisbibliothek und eine weitere für eine Kapelle genutzt wurde. Die Zellen waren etwa 3 Meter lang, 2,7 Meter breit und 4 Meter hoch.
Garten
Der Höhepunkt des Gefängnisses aus der Sicht der Insassen war der Garten. Der Gartenraum war zunächst in kleine persönliche Parzellen unterteilt, die von jedem Häftling auf vielfältige Weise genutzt wurden, in der Regel für den Anbau von Gemüse. Dönitz bevorzugte den Anbau von Bohnen, Funktomaten und Speerblumen, obwohl der sowjetische Direktor Blumen anschließend eine Zeitlang verboten hat. Laut Vorschrift sollten alle Produkte für die Gefängnisküche verwendet werden, aber Häftlinge und Wärter umgingen diese Regel oft und ließen sich von den Gaben des Gartens verwöhnen. Als die Gefängnisvorschriften nachließen und die Gefangenen entweder apathisch oder zu krank wurden, um ihre Parzellen zu pflegen, wurde der Garten zu einem großen bearbeitbaren Bereich zusammengefasst. Dies kam dem ehemaligen Architekten Speer entgegen, der als einer der jüngsten und lebendigsten Häftlinge später die Aufgabe übernahm, das gesamte Grundstück in einen großen, komplexen Garten mit Wegen, Steingärten und Blumenausstellungen umzugestalten. An Tagen ohne Zugang zum Garten, zum Beispiel wenn es regnete, nahmen sich die Häftlinge die Zeit, gemeinsam Umschläge im Hauptgang zu gestalten.
Kontroverse
Die alliierten Mächte übernahmen das Gefängnis ursprünglich im November 1946 in der Erwartung, dass es hundert oder mehr Kriegsverbrecher beherbergen würde. Neben den etwa sechzig Soldaten, die zu jeder Zeit im oder um das Gefängnis herum Dienst taten, gab es Teams von professionellen zivilen Wärtern aus jedem der vier Länder, vier Gefängnisdirektoren und ihre Stellvertreter, vier Sanitätsoffiziere der Armee, Köche, Übersetzer, Kellner, Träger und andere. Man hielt dies für den falschen Weg, das Geld und die Ressourcen zu verwenden, und es wurde zu einem ernsten Streitpunkt unter den Gefängnisdirektoren, Politikern aus ihren jeweiligen Ländern. Die Westberliner Regierung war besonders unglücklich über die Vorkehrungen, weil sie viel Geld kostete, aber in ihrem eigenen Gefängnissystem immer noch Raummangel herrschte.