"Owen: der hervorragendste Wirbeltier-Zoologe und Paläontologe... aber ein höchst hinterlistiger und abscheulicher Mann". Richard Broke Freeman (Charles Darwin: ein Gefährte. Dawson 1978)
Owen schrieb sich selbst und Georges Cuvier die Entdeckung des Iguanodon zu, wobei er jegliche Anerkennung des ursprünglichen Entdeckers des Dinosauriers, Gideon Mantell, völlig ausschloss. Dies war nicht das erste oder letzte Mal, dass Owen absichtlich eine Entdeckung als seine eigene behauptete, obwohl dies in Wirklichkeit nicht der Fall war. Owen wurde schließlich wegen Plagiats aus dem Zoologischen Rat der Royal Society entlassen.
Owen äußerte sich sehr kritisch zu Darwins "On the Origin of Species" (Über den Ursprung der Arten), zum Teil deshalb, weil Darwin sich nicht viel auf die früheren wissenschaftlichen Evolutionstheorien bezog. Stattdessen verglich Darwin die Theorie der Evolution durch natürliche Auslese mit der unwissenschaftlichen Theorie in der Bibel.
Owen war nach Darwins Meinung "boshaft, extrem bösartig, klug; die Londoner sagen, er sei verrückt vor Neid, weil so viel über mein Buch gesprochen wird". "Es ist schmerzhaft, in dem intensiven Ausmaß gehasst zu werden, in dem Owen mich hasst".
Owen war auch an der Drohung beteiligt, die staatliche Finanzierung des Royal Botanic Gardens und der botanischen Sammlung von Kew zu beenden (siehe Joseph Dalton Hooker):
"An der Wurzel lag Owens Gefühl, dass Kew dem British Museum (und Owen) unterstellt werden sollte und sich nicht als unabhängige wissenschaftliche Institution mit dem Vorteil eines großen botanischen Gartens entwickeln durfte.
Im ersten Teil seiner Karriere wurde Owen zu Recht als eine der großen wissenschaftlichen Persönlichkeiten seiner Zeit angesehen. Im zweiten Teil seiner Karriere rutschte sein Ruf ab. Dies lag nicht nur an seinem hinterhältigen Umgang mit Kollegen, sondern auch an den schwerwiegenden wissenschaftlichen Fehleinschätzungen, die entdeckt und publik gemacht wurden. Ein gutes Beispiel dafür war seine Entscheidung, den Menschen in eine eigene Unterklasse der Mammalia einzuordnen (siehe Thomas Henry Huxley). In dieser hatte Owen überhaupt keine Anhänger. Auch seine Unwilligkeit, sich bezüglich der Evolution vom Zaun zu brechen, schadete seinem Ruf im Laufe der Zeit immer mehr.
Owen arbeitete nach seiner offiziellen Pensionierung im Alter von 79 Jahren weiter, aber er erholte sich nie wieder von den guten Meinungen, die er in seiner Jugend bekommen hatte.