Fünf Schichten bilden die Atmosphäre der Sonne. Die Chromosphäre, die Übergangsregion und die Korona sind viel heißer als die äußere Photosphärenoberfläche der Sonne. Es wird vermutet, dass Alfvén-Wellen hindurchtreten können, um die Korona zu erwärmen.
Die Zone mit der niedrigsten Temperatur, die kühlste Schicht der Sonne, liegt etwa 500 Kilometer (310 Meilen) über der Photosphäre. Sie hat eine Temperatur von etwa 4.100 K (3.830 °C; 6.920 °F). Dieser Teil der Sonne ist kühl genug, um die Bildung einfacher Moleküle wie Kohlenmonoxid und Wasser zu ermöglichen. Diese Moleküle können auf der Sonne mit speziellen Instrumenten, Spektroskopen genannt, gesehen werden.
Die Chromosphäre ist die erste Schicht der Sonne, die man sehen kann, insbesondere während einer Sonnenfinsternis, wenn der Mond den größten Teil der Sonne bedeckt und das hellste Licht blockiert.
Die solare Übergangsregion ist der Teil der Sonnenatmosphäre, der sich zwischen der Chromosphäre und dem äußeren Teil, der Korona genannt wird, befindet. Sie kann vom Weltraum aus mit Teleskopen gesehen werden, die ultraviolettes Licht wahrnehmen können. Der Übergang liegt zwischen zwei sehr unterschiedlichen Schichten. Im unteren Teil berührt er die Photosphäre und die Schwerkraft formt die Merkmale. Im oberen Teil berührt die Übergangsschicht die Korona.
Die Korona ist die äußere Atmosphäre der Sonne und ist viel größer als der Rest der Sonne. Die Korona dehnt sich kontinuierlich in den Raum aus und bildet den Sonnenwind, der das gesamte Sonnensystem ausfüllt. Die durchschnittliche Temperatur der Korona und des Sonnenwindes beträgt etwa 1.000.000-2.000.000 K (1.800.000-3.600.000 °F). In den heißesten Regionen beträgt sie 8.000.000.000-20.000.000 K (14.400.000-36.000.000 °F). Wir verstehen nicht, warum die Korona so heiß ist. Sie kann während einer Sonnenfinsternis oder mit einem Instrument namens Koronagraphen gesehen werden.
Die Heliosphäre ist die dünne äußere Atmosphäre der Sonne, die mit dem Plasma des Sonnenwindes gefüllt ist. Sie erstreckt sich über die Umlaufbahn des Pluto hinaus bis zur Heliopause, wo sie eine Grenze bildet, an der sie mit dem interstellaren Medium kollidiert.