Der Gharial hat eine lange, schmale Schnauze. Dies ist das Merkmal, das sich am meisten von den meisten anderen Krokodilen unterscheidet. Die einzige andere Art, die eine solche Schnauze hat, ist das Falsche Gharial (Tomistoma schlegelii), das eng verwandt ist. Die Form dieser Schnauze verändert sich, wenn das Tier älter wird. Die Schnauze wird zunehmend dünner, je älter der Gharial wird. An der Schnauzenspitze des Männchens befindet sich ein knolliger Wuchs. Dies wird als "Ghara" (nach dem indischen Wort für "Topf") bezeichnet. Es ist nur bei reifen Tieren vorhanden. Es wird für verschiedene Aktivitäten verwendet, z.B. für das Erzeugen eines Resonanzbrummens während der Vokalisierung. Es wird auch zum Anlocken von Weibchen verwendet. Das Paarungsritual umfasst einen Abschnitt, in dem das Männchen diese Ghara benutzt, um Blasen zu machen.
Die langen Kiefer sind mit vielen ineinandergreifenden, rasiermesserscharfen Zähnen besetzt. Dies ist eine Anpassung an die Ernährung (bei Erwachsenen vorwiegend Fisch). Diese Art ist eine der grössten aller Krokodilarten und nähert sich dem Salzwasserkrokodil (Crocodylus porosus) und dem Nilkrokodil in maximaler Grösse - die Männchen erreichen eine Länge von mindestens 5 Metern und nähern sich oft bis zu 6 Metern. Berichte über 7-Meter-Tiere existieren, sind aber unbestätigt. Die Beinmuskulatur des Gharials ist nicht dazu geeignet, dem Tier das Anheben des Körpers vom Boden (an Land) zu ermöglichen, um den Hochgeh-Gang zu erreichen - es kann seinen Körper nur nach vorne über den Boden schieben ("Bauchgleiten"), obwohl es dies bei Bedarf mit einer gewissen Geschwindigkeit tun kann. Im Wasser ist der Gharial jedoch das wendigste und schnellste aller Krokodile der Welt. Der Schwanz scheint überentwickelt und ist seitlich abgeflacht, mehr als bei anderen Krokodilen. Dadurch kann es die hervorragenden Schwimmeigenschaften erreichen.
Das Gharial hat 27 bis 29 obere und 25 oder 26 untere Zähne auf jeder Seite. Diese Zähne werden nicht in Interdentalgruben aufgenommen; die ersten, zweiten und dritten Unterkieferzähne passen in Kerben im Oberkiefer. Die Vorderzähne sind die größten. Die Schnauze des Gharials ist schmal und lang, mit einer Erweiterung am Ende, und seine Nasenbeine sind vergleichsweise kurz und weit von den Vorkieferknochen entfernt. Die Nasenöffnung eines Gharials ist kleiner als die supra-temporalen Fossae. Der untere vordere Rand der Augenhöhle (Jugal) des Gharials ist erhöht, und die Symphysis mandibularis ist extrem lang und reicht bis zum 23. oder 24. Ein dorsaler Schild wird aus vier Längsreihen nebeneinander liegender, gekielter und knöcherner Schilde gebildet.
Die Länge der Schnauze beträgt das 3,5-fache (bei Erwachsenen) bis 5,5-fache (bei Jugendlichen) der Breite der Schnauzenbasis. Nacken- und Rückenschild bilden einen einzigen durchgehenden Schild, der aus 21 oder 22 Querreihen besteht. Ghariale haben zusätzlich zu den knöchernen Dorsalschuppen eine äußere Reihe von weichen, glatten oder schwachkegeligen Schuppen. Sie haben auch zwei kleine post-okzipitale Schuppen.
Die äußeren Zehen eines Gharials sind zu zwei Dritteln mit Schwimmhäuten versehen, während die mittlere Zehe zu einem Drittel mit Schwimmhäuten versehen ist. Gharials haben einen starken Kamm an der Außenkante des Unterarms, des Beins und des Fußes. Typischerweise haben erwachsene Gharials einen dunklen olivfarbenen Farbton, während junge Gharials helloliv sind, mit dunkelbraunen Flecken oder Querbändern.