Alle Runden in der Endphase sind zweibeinig, mit Ausnahme des Finales. Sollte die Gesamtpunktzahl nach der regulären Spielzeit im Rückspiel gleich sein, gewinnt diejenige Mannschaft, die im Auswärtsspiel mehr Tore erzielt hat: Wenn die Tore in beiden Spielen identisch waren, wird die Verlängerung gespielt. Die Auswärtstorregel gilt auch dann, wenn die Tore am Ende der Verlängerung gleich sind. Wenn in der Verlängerung keine Tore erzielt wurden, wird das Unentschieden durch Elfmeterschießen entschieden. Die Mannschaft, die bei jedem Unentschieden zuerst aus dem Hut ist, spielt das Hinspiel zu Hause und das Rückspiel auswärts.
Klammer
Vorlage:UCBracket
Runde der 32
Die Auslosung der Runde der 32, die von UEFA-Generalsekretär David Taylor und Michele Centenaro, dem Leiter der UEFA-Klubwettbewerbe, durchgeführt wurde, fand am Freitag, 21. Dezember 2007, um 13:00 Uhr MEZ in Nyon (Schweiz) statt. Die acht Gruppensieger wurden gegen die acht drittplatzierten Teams ausgelost, während die acht zweitplatzierten Teams gegen die acht Teams, die in den Champions-League-Gruppen Dritter wurden, ausgelost wurden. Mannschaften derselben Gruppe oder desselben Landes können nicht zusammen ausgelost werden.
Die Hinspiele wurden am 13. Februar und 14. Februar 2008 gespielt. Das Rückspiel wurde am 21. Februar 2008 gespielt.
| Mannschaft #1 | Agg. | Mannschaft #2 | 1. Etappe | 2. Spielabschnitt |
| Aberdeen  | 3–7 | Bayern München | 2–2 | 1–5 |
| AEK Athen  | 1–4 | Getafe | 1–1 | 0–3 |
| Bolton-Wanderer  | 1–0 | Atlético Madrid | 1–0 | 0–0 |
| Zenit St. Petersburg  | 2–2 (a) | Villarreal | 1–0 | 1–2 |
| Galatasaray  | 1–5 | Bayer Leverkusen | 0–0 | 1–5 |
| Anderlecht .svg(1).png) | 3–2 | Bordeaux | 2–1 | 1–1 |
| Brann  | 1–8 | Everton | 0–2 | 1–6 |
| Zürich  | 1–3 | Hamburg | 1–3 | 0–0 |
| Förster  | 1–1 (a) | Panathinaikos | 0–0 | 1–1 |
| PSV Eindhoven  | 4–1 | Helsingborg | 2–0 | 2–1 |
| Slawien Prag  | 2–3 | Tottenham Hotspur | 1–2 | 1–1 |
| Rosenborg  | 1–3 | Fiorentina | 0–1 | 1–2 |
| Sportliche CP  | 5–0 | Basel | 2–0 | 3–0 |
| Werder Bremen  | 4–0 | Braga | 3–0 | 1–0 |
| Benfica  | 3–2 | Nürnberg | 1–0 | 2–2 |
| Marseille  | 3–2 | Spartak Moskau | 3–0 | 0–2 |
Achtelfinale
Die Auslosung für das Achtelfinale, die von UEFA-Generalsekretär David Taylor geleitet wurde, fand ebenfalls am Freitag, 21. Dezember 2007 um 13:00 Uhr MEZ in Nyon (Schweiz) statt. Die Hinspiele wurden am 6. März 2008 ausgelost. Das Rückspiel fand am 12. und 13. März 2008 statt. Im Gegensatz zu den vorherigen Runden können die Mannschaften derselben Gruppe oder desselben Landes ab dem Achtelfinale zusammengezogen werden.
| Mannschaft #1 | Agg. | Mannschaft #2 | 1. Etappe | 2. Spielabschnitt |
| Anderlecht .svg(1).png) | 2–6 | Bayern München | 0–5 | 2–1 |
| Förster  | 2–1 | Werder Bremen | 2–0 | 0–1 |
| Bolton-Wanderer  | 1–2 | Sportliche CP | 1–1 | 0–1 |
| Bayer Leverkusen  | 3–3 (a) | Hamburg | 1–0 | 2–3 |
| Benfica  | 1–3 | Getafe | 1–2 | 0–1 |
| Fiorentina  | 2–2 (4–2p) | Everton | 2–0 | 0-2 (aet) |
| Tottenham Hotspur  | 1–1 (5–6p) | PSV Eindhoven | 0–1 | 1-0 (aet) |
| Marseille  | 3–3 (a) | Zenit St. Petersburg | 3–1 | 0–2 |
Viertelfinale
Die Auslosung für das Viertelfinale, Halbfinale und Finale, die von UEFA-Generalsekretär David Taylor und Denis Law, dem Botschafter für das Finale in Manchester, durchgeführt wurde, fand am Freitag, 14. März 2008, um 14:00 Uhr MEZ in Nyon (Schweiz) statt. Das Hinspiel des Viertelfinales wurde am 3. April und das Rückspiel am 10. April 2008 ausgetragen.
| Mannschaft #1 | Agg. | Mannschaft #2 | 1. Etappe | 2. Spielabschnitt |
| Bayer Leverkusen  | 2–4 | Zenit St. Petersburg | 1–4 | 1–0 |
| Förster  | 2–0 | Sportliche CP | 0–0 | 2–0 |
| Bayern München  | 4–4 (a) | Getafe | 1–1 | 3-3 (aet) |
| Fiorentina  | 3–1 | PSV Eindhoven | 1–1 | 2–0 |
Halbfinale
Die Halbfinalspiele fanden am 24. April und 1. Mai 2008 statt.
| Mannschaft #1 | Agg. | Mannschaft #2 | 1. Etappe | 2. Spielabschnitt |
| Bayern München  | 1–5 | Zenit St. Petersburg | 1–1 | 0–4 |
| Förster  | 0–0 (4–2p) | Fiorentina | 0–0 | 0-0 (aet) |
Finale
Das Finale bestritten die russische Mannschaft Zenit St. Petersburg und die schottischen Rangers am 14. Mai 2008 im City of Manchester Stadium in Manchester, England. Zenit gewann die Partie mit 2:0, wobei Tore von Igor Denisov und Konstantin Zyryanov in den letzten 20 Spielminuten zum ersten UEFA-Pokal-Titel für Zenit führten.
Die Nacht wurde durch Ausschreitungen einer Minderheit von Ranger-Anhängern im Stadtzentrum von Manchester getrübt.
| Sieger des UEFA-Pokals2007-08 |
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| FC Zenit St. Petersburg Erster Titel |