Die meisten halophilen und salzfressenden Tiere verwenden Energie, um Salz aus ihrem Zytoplasma zu entfernen. Normalerweise würden Organismen, die in der Nähe von viel Salz leben, Wasser verlieren und aufgrund von Osmose sterben. Das Wasser innerhalb des Organismus würde sich vom Inneren der Zelle in die äußere Umgebung bewegen. Der Grund dafür ist, dass es immer eine Bewegung des Wassers gibt, um einen Zustand zu erreichen, in dem die Salzkonzentrationen auf beiden Seiten der Zellmembran gleich sind.
Um zu überleben, muss das Zytoplasma der Halophilen isotonisch mit seiner Umgebung sein.
Um in diesen Zustand zu gelangen, verwenden Halophile zwei verschiedene Methoden. Bei der ersten (hauptsächlich von Bakterien, einigen Archaeen, Hefen, Algen und Pilzen verwendet) werden organische Verbindungen im Zytoplasma gespeichert. Diese Verbindungen helfen dem Organismus, den Stress der Osmose zu überleben. Die für diesen Prozess am häufigsten verwendeten gelösten Stoffe sind neutral und enthalten Aminosäuren und Zucker. Vorteile dieser Methode sind, dass Organismen in einem größeren Bereich von Salzkonzentrationen leben können. Wenn Proteine keinen hohen Salzkonzentrationen ausgesetzt sind, müssen sie sich auch nicht an hohe Salzkonzentrationen anpassen. Es erfordert, dass der Organismus viel mehr Energie verbraucht als die unten beschriebene Anpassung.
Die zweite, weniger häufige Anpassung ist die selektive Aufnahme von Kalium-(K+)-Ionen in das Zytoplasma. Im Gegenzug pumpt der Organismus mit Hilfe der Natrium-Kalium-Pumpe Natrium-(Na+)-Ionen aus dem Zytoplasma heraus. Anstelle von Kalium können Natriumionen verwendet werden, am häufigsten wird jedoch Kalium verwendet. Diese Anpassung wird nur von einer Ordnung von Bakterien und einer Familie von Archaeen verwendet. Ein Vorteil dieser Methode besteht darin, dass sie viel weniger Energie verbraucht als die obige Adaptation. Der Hauptnachteil dieser Anpassung besteht darin, dass die gesamte Maschinerie innerhalb der Zelle (Enzyme, Strukturproteine usw.) an einen hohen Gehalt an anorganischen Ionen und einen hohen Salzgehalt angepasst werden muss. Dies ist viel anspruchsvoller als die oben beschriebene Anpassung.
Die meisten halophilen Organismen verwenden nur eine der beiden Methoden, aber einige wenige Halophile können beide anwenden.